Obis について
Obis は、OBIS の海洋生物多様性データを検索する MCP サーバーで、研究者やデータ分析担当者向けです。分類群の照合、位置情報付き出現記録の検索、集計統計を提供し、ローカルの stdio でも動作します。
主な機能
- 01海洋分類群名と分類情報の照合
- 02位置情報付き出現記録の検索
- 03日付範囲による記録の絞り込み
- 04分類群の集計統計の取得
活用シーン
- 01海洋生物の分類記録の確認
- 02種の出現場所と日付の調査
- 03分類群の記録数とデータセットの集計
MCP 対応
MCP クライアントに、OBIS の分類群、出現記録、統計ツールを提供します。Pipeworx ゲートウェイ経由で接続するほか、ローカルの stdio MCP サーバーとして実行できます。
設定
リモートサーバーはインストール不要です。クライアントを選んで設定をコピーするか、ワンクリックで導入できます。
https://gateway.pipeworx.io/obis/mcpclaude mcp add --transport http pipeworx-io-obis https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp{"mcpServers":{"pipeworx-io-obis":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp"}}}Cursor で開く{"servers":{"pipeworx-io-obis":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp"}}}VS Code で開く{"mcpServers":{"pipeworx-io-obis":{"type":"http","url":"https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp"}}}{"mcpServers":{"pipeworx-io-obis":{"serverUrl":"https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp"}}}コマンドはターミナルで実行し、JSON は各クライアントの MCP 設定に貼り付けて再起動します。認可が必要なサーバーは初回接続時にログインを求めます。
ツール
詳細
mcp-obis
OBIS(Ocean Biodiversity Information System)MCP。
Pipeworx の一部です — AI エージェントを1683以上の稼働中のデータソースに接続するMCPゲートウェイです。
ツール
| ツール | 説明 |
|---|---|
get_taxon | OBISで海洋生物の種名/属名/科名を照合し、その分類群レコード(分類群ID、階級、採用名、界/門/科/属、出現レコードの総数)を取得します。OBISは海洋に特化した世界規模の海洋生物多様性出現データベースで、GBIFを補完します。キーは不要です。 |
find_occurrences | OBISから、学名に一致する位置情報付きの海洋生物出現レコード(緯度、経度、日付、水深、国、地域、記録の根拠)を検索します。任意で日付範囲を指定して絞り込めます。一致総数とレコードのサンプルを返します。 |
get_statistics | 海洋生物の分類群について、OBISの集計統計を取得します。出現レコードの総数、異なる種/分類群の数、提供元データセット、観測年の範囲が含まれます。 |
クイックスタート
MCP クライアント(Claude Desktop、Cursor、Windsurf など)に追加します:
{
"mcpServers": {
"obis": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp"
}
}
}
このエンドポイントが実際に提供するもの
https://gateway.pipeworx.io/obis/mcp の tools/list は、上記の表にあるツールに加えて、Pipeworx 共通のメタツール(ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember/recall など、ゲートウェイ全体で使えるツール群)も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック独自のツールに加えて、共通ツールが約30個一覧表示されます。接続の initialize 応答には正確な対象範囲が記載されており、その日の状況を確認するための信頼できる情報源です。
これは意図的な設計であり、偶然の多重化ではありません。メタツールを使うと、このパックが対応していない質問にも ask_pipeworx 経由でカタログ全体から回答できます。つまり、2つ目のMCP サーバーを追加する必要はありません。現在、これらのメタツールなしでパックのエンドポイントを接続する方法はありません。追加のスキーマが、ルーティングの利点を上回るコンテキストを消費する場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。
または、Pipeworx のフルゲートウェイに接続すると、このパックのツールだけでなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます:
{
"mcpServers": {
"pipeworx": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
}
}
}
どちらのURLも同じゲートウェイと同じ1683以上のデータソースに接続します。違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかだけです。どちらからでも ask_pipeworx を使ってすべてのツールにアクセスできます。
MCP クライアントがない場合:HTTP経由で呼び出す
curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/obis_get_taxon \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"name":"Orcinus orca"}'
最初の呼び出しにアカウントは不要です。ツールの詳細を確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/obis_get_taxon を実行します。ツールを検索するには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を実行します。
スタンドアロン(ゲートウェイアカウント不要)
このパッケージはローカルのstdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworx アカウントも、ゲートウェイへの往復通信も不要です:
{
"mcpServers": {
"obis": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@pipeworx/mcp-obis"]
}
}
}
起動することを確認するため、直接実行することもできます:
npx -y @pipeworx/mcp-obis
stdin/stdout経由でMCPを使用し、このパックのツールだけを対象に initialize/tools/list/tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共通メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。
ask_pipeworx を使う
ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。これは上記のパックエンドポイントでも、フルゲートウェイでも利用できます:
ask_pipeworx({ question: "your question about Obis data" })
ゲートウェイが適切なツールを選択し、引数を自動的に設定します。
詳細情報
ライセンス
MIT
コメント
AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。