Quickgo

mcp-quickgo

QuickGO (EBI) MCP — Gene Ontology ブラウザー。

Pipeworx の一部です — AI エージェントを1683以上のライブデータソースに接続するMCPゲートウェイです。

ツール

ツール	説明
search_terms	QuickGO (EBI) — キーワードでGene Ontology (GO) の用語を検索します。「apoptosis」のような自由記述のクエリに一致するGO用語（ID＋名前）を返します。キーは不要です。
get_term	QuickGO (EBI) — IDで単一のGene Ontology (GO) 用語を取得します。名前、アスペクト（biological_process|molecular_function|cellular_component）、定義、同義語、廃止フラグを返します。キーは不要です。
gene_annotations	QuickGO (EBI) — UniProtアクセッション（例：「P04637」）で識別される遺伝子／タンパク質のGene Ontology (GO) アノテーションを一覧表示します。GO ID、名前、アスペクト、エビデンス、分類群を返します。キーは不要です。

クイックスタート

MCP クライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurfなど）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "quickgo": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/quickgo/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/quickgo/mcp の tools/list は、上の表に記載されたツールに加えて、Pipeworx共通のメタツール — ask_pipeworx、 discover_tools、search_within、remember／recall、その他ゲートウェイ全体で利用できるツール一式を返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントには、そのパック独自のツールとともに、共通ツールがおよそ30個表示されます。接続の initialize レスポンスに正確な範囲が記載されており、その日の状況を確認する際の正式な情報源になります。

これは意図的な設計であり、偶然に多重化されているわけではありません。メタツールを使うことで、このパックが対応していない質問にも、カタログ全体を対象にルーティングする ask_pipeworx を介して回答できます。そのため、MCP サーバーをもう1つ追加する必要はありません。現在、これらのメタツールを含めずにパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加スキーマに必要なコンテキスト量がルーティングの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度だけ接続してください。

または、フル Pipeworx ゲートウェイに接続すると、このパックだけでなく、すべてのパックのツールが直接一覧表示されます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも、同じゲートウェイと同じ1683以上のデータソースに接続します。唯一の違いは、どのパックのツールが直接一覧表示されるかです。どちらから接続しても、ask_pipeworx ですべてのツールを利用できます。

MCP クライアントがない場合：HTTP経由で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_terms \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"apoptosis"}'

最初の呼び出しにはアカウントは不要です。任意のツールを確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_terms を使用します。ツールを探すには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を使用します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージは、ローカルのstdio MCP サーバーとしても実行できます。Pipeworxアカウントも、ゲートウェイを経由した通信も不要です。

{
  "mcpServers": {
    "quickgo": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-quickgo"]
    }
  }
}

または、起動を確認するために直接実行します。

npx -y @pipeworx/mcp-quickgo

stdin/stdout経由でMCP通信を行い、このパックのツールのみを対象に、initialize／tools/list／tools/call に応答します。上記のゲートウェイ接続で追加される共通メタツールは含まれません。同じソース、同じツールで、ask_pipeworxによるルーティングはありません。

ask_pipeworxを使う

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。これは、上記のパックエンドポイントでもフルゲートウェイでも利用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Quickgo data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT