Rhea

mcp-rhea

Rhea MCP — 生化学反応の専門家監修データベースです。

Pipeworx の一部です。AI エージェントを1683以上のライブデータソースに接続するMCPゲートウェイです。

ツール

ツール	説明
search_reactions	生化学反応の専門家監修データベースであるRheaを検索します（UniProtとKEGGが参照する反応データベースです）。化合物名、ChEBI ID、EC番号、またはキーワードで酵素反応や代謝反応を検索し、バランスの取れたプレーンテキストの反応式と、ECおよびChEBIの相互参照を取得します。キーは不要です。
get_reaction	Rhea ID（例：「RHEA:14293」または「14293」）で、単一のRhea反応を取得します。バランスの取れたプレーンテキストの反応式に加えて、EC番号、ChEBI化合物、UniProt酵素、PubMedの相互参照を返します。Rheaは、UniProtとKEGGが参照する生化学反応の専門家監修データベースです。キーは不要です。

クイックスタート

MCPクライアント（Claude Desktop、Cursor、Windsurfなど）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "rhea": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/rhea/mcp"
    }
  }
}

このエンドポイントが実際に提供するもの

https://gateway.pipeworx.io/rhea/mcp の tools/list は、上記の表にあるツールに加えて、Pipeworx共通のメタツール（ask_pipeworx、discover_tools、search_within、remember／recall など、ゲートウェイ全体で利用できるツール群）も返します。そのため、表示されるツール数はこの表より多くなります。現在、単一パックのエンドポイントでは、パック独自のツールに加えて共通ツールが約30個表示されます。接続の initialize レスポンスには正確な対象範囲が記載され、その日の状況を確認するための正式な情報となります。

これは意図的な仕様であり、偶然に多重化されているわけではありません。メタツールを使うと、このパックの対象外の質問にも対応できます。ask_pipeworx がカタログ全体から適切なツールに振り分けるため、MCPサーバーを追加する必要はありません。現時点では、メタツールなしでパックのエンドポイントをマウントする方法はありません。追加のスキーマによるコンテキスト消費が振り分けの利点を上回る場合は、複数のパックエンドポイントではなく、フルゲートウェイに一度接続してください。

または、フルPipeworxゲートウェイに接続すると、このパックだけでなく、すべてのパックのツールが一覧に直接表示されます。

{
  "mcpServers": {
    "pipeworx": {
      "url": "https://gateway.pipeworx.io/mcp"
    }
  }
}

どちらのURLも、同じゲートウェイと同じ1683以上のデータソースに接続します。異なるのは、どのパックのツールが一覧に直接表示されるかだけです。どちらから接続しても、ask_pipeworx からすべてのツールにアクセスできます。

MCPクライアントをお持ちでない場合：HTTP経由で呼び出す

curl -X POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_reactions \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"query":"glucose"}'

最初の呼び出しにアカウントは不要です。ツールの詳細を確認するには、GET https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_reactions を使用します。ツールを検索するには、{"query":"..."} を指定して POST https://gateway.pipeworx.io/v1/tools/search_packs を使用します。

スタンドアロン（ゲートウェイアカウント不要）

このパッケージはローカルのstdio MCPサーバーとしても実行でき、Pipeworxアカウントもゲートウェイ経由の通信も必要ありません。

{
  "mcpServers": {
    "rhea": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@pipeworx/mcp-rhea"]
    }
  }
}

または、直接実行して起動を確認します。

npx -y @pipeworx/mcp-rhea

stdin/stdout経由でMCPを使用し、initialize／tools/list／tools/call に応答します。対象となるのはこのパック独自のツールのみで、上記のゲートウェイ接続で追加される共通メタツールは含まれません。同じソース、同じツールを使用しますが、ask_pipeworxによる振り分けはありません。

ask_pipeworxを使う

ツールを直接呼び出す代わりに、自然な英語で質問できます。この方法は、上記のパックエンドポイントとフルゲートウェイの両方で使用できます。

ask_pipeworx({ question: "your question about Rhea data" })

ゲートウェイが適切なツールを選び、引数を自動的に設定します。

詳細情報

• ドキュメントとガイド
• pipeworx.io

ライセンス

MIT