sniff-mcp

sniff-mcp — エージェントから呼び出せる犬のゲノミクス

犬のDNAを参照するための基盤です。 Sniff Atlasを提供する、稼働中のオープンAPIとMCPサーバーです。CanFam4の188犬種にわたるゲノム全体の9,667,790個の変異について、犬種ごとに層別化したアレル頻度を収録しています。SnpEffアノテーション、Pangolinのスプライス値、ZoonomiaのphyloP保存度、および変異 ⇄ 遺伝子 ⇄ 犬種 ⇄ 疾患のナレッジグラフも備えています。いかなる変異にも病原性を割り当てません。すべての応答に、引用情報と出典情報が含まれます。

犬、犬種、犬の健康に関するものを開発していますか？ これはそのためのデータレイヤーです。キーも登録も不要です。エージェントやアプリから接続するだけです。

• 🔌 MCP エンドポイント： https://mcp.sniff.world/mcp/（Streamable HTTP。現在のツール一覧は/v1/metadataで提供）— askを含みます。これは、引用付きデータだけを根拠に回答し、根拠がなければ正直に回答を控える犬の遺伝学に関するQ&Aです（犬の健康に関する助言を捏造しません）。また、disease_bridge（ACMG形式の病原性グレードと、犬⇄ヒトの相同遺伝子を含む遺伝性疾患の要素）も含みます。
• 🌐 REST API： https://api.sniff.world/（OpenAPI ドキュメント · llms.txt）
• 📚 データセット： 10.5281/zenodo.20566358（CC-BY-4.0）

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コーディングエージェントに追加する（コピーして貼り付け）

ホスト型サーバーは公開されており、認証は不要です。使用するツールを選んでください。

Claude Code

claude mcp add --transport http sniff https://mcp.sniff.world/mcp/

Cursor / Windsurf / VS Code — MCP 設定（.cursor/mcp.json、mcp.jsonなど）に追加します。

{
  "mcpServers": {
    "sniff": { "url": "https://mcp.sniff.world/mcp/" }
  }
}

Claude Desktopまたはstdioのみのクライアント（ローカルブリッジ経由でホスト型サーバーを使用）：

{
  "mcpServers": {
    "sniff": { "command": "npx", "args": ["-y", "sniff-mcp"] }
  }
}

これで完了です。エージェントに次のように尋ねてください。「犬種ごとのCPT2 5:56189113の頻度は？」 または 「DLA遺伝子内の影響度がHIGHの変異を探して」。

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REST APIを使う（Webアプリ向け）

SDKは不要です。通常のHTTP/JSONです。

curl https://api.sniff.world/v1/variant/5:56189113

{
  "variant_id": "5:56189113", "ref": "A", "alt": "G",
  "global_af": 0.0185, "popmax_af": 0.591, "popmax_breed": "akita",
  "consequence": "missense_variant", "impact": "MODERATE",
  "gene": "CPT2", "phylop_241way": 6.36,
  "provenance": { "dataset_doi": "10.5281/zenodo.20566358",
                  "predicted_disease_relevance": "UNPROVEN", "...": "..." }
}

// JavaScript / TypeScript
const r = await fetch("https://api.sniff.world/v1/variant/5:56189113/context?breed=akita");
const ctx = await r.json(); // frequency + annotations + gene + cross-breed + provenance

エンドポイント	返される内容
GET /v1/variant/{pos}	単一の変異：AF、popmax、結果、遺伝子、Pangolin、phyloP
GET /v1/variant/{pos}/context	結合クエリ — 1回の呼び出しで得られる、変異に関するすべての情報
GET /v1/breed/{breed}	犬種プロファイル（上位の変異、幾何学的特徴、最も近い犬種）
GET /v1/breed/{breed}/nearest	遺伝的に最も近い犬種（PCA距離）
GET /v1/gene/{symbol}	遺伝子内の変異を影響度順に表示
GET /v1/semantic?q=	自然言語検索（「古代の北極圏のそり犬」）
GET /v1/search	9.67M個の全変異を対象にした、条件指定による検索
GET /v1/metadata	リリース、DOI、件数、対象範囲のバナー

位置はCanFam4のchrom:pos形式です（例：5:56189113）。スキーマ全体については、**https://api.sniff.world/openapi.json**を参照してください。

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セルフホスト（任意）

uvx sniff-mcp          # run the MCP server locally (needs the release data on disk)
pip install sniff-mcp  # or install into your env

ARCHITECTURE.mdとDockerfileを参照してください。手軽に利用するにはホスト型エンドポイントがおすすめです。セルフホストは、エアギャップ環境や大量利用向けです。

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これは何か（そして何ではないか）

CanVAS（14,478 頭の犬、Beagle でインピュテーション、MAF≥1%）と、投影されたコミュニティコホートを基に構築されています。注釈は分類ではありません。すべての応答には predicted_disease_relevance: "UNPROVEN" のフラグが付けられており、Pangolin の値は第三者モデルの出力であって、犬で検証されたものではありません。これは研究と探索のためのリソースであり、臨床診断用ではありません。 対象範囲（一般的な変異と低頻度変異、MAF≥1%）と UNPROVEN という注意事項は、すべての応答の provenance ブロックに含まれているため、エージェントが引用する内容は、正確さを保ち、出典も明示されます。

引用

Gehring, M. (2026). Sniff Atlas. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.20566358 (CC-BY-4.0)

@dataset{sniff_atlas_2026,
  author    = {Gehring, Matt},
  title     = {Sniff Atlas},
  year      = {2026},
  publisher = {Zenodo},
  doi       = {10.5281/zenodo.20566358},
  url       = {https://sniff.world}
}

コード MIT · データ CC-BY-4.0 · world.sniff/sniff-mcp · https://sniff.world