digest-paper

論文のダイジェスト作成

論文を最初から最後まで読み込み、sota/papers/<citekey>/ にまとめます。これはSOTA作業の最小単位です。完全に完了するか、実行されないかのどちらかです。途中までのダイジェストは決して残さないでください。

最初に読むもの

• sota/README.md — 統合の形式とダイジェスト作成のルール（形式はひな型に従います）
• references/bibliography-rules.md — citekey、バージョンの解決、相互検証

MCP 事前確認（必須ゲート）

何よりも先に、学術系 MCP サーバーにそれぞれ簡単なクエリを1件ずつ送って応答を確認します（例：既知のタイトルを検索）。ゲートの基準はAPIキーではなく、機能です。キーがない場合は利用が制限されるだけで、ゲートを通過できなくなることはありません。

• 必須： arxiv（全文）が応答すること、かつ書誌情報ソースのうち少なくとも1つ（semantic-scholar、dblp、openalex）が応答すること。
• 必須の機能が利用できない場合：作業を停止し、応答しなかったサーバーを報告して、MCP の設定を修正するようユーザーに依頼します。
• 接続可能なソースがダウンしていてもゲートを満たしていれば、作業を続行し、統合時に相互確認が限定されたことを記載します。

モデルの記憶、ウェブ検索、スクレイピングに頼ることは決してありません。引用情報として扱えるのは、MCP の検索で取得したものだけです。

手順

1. 論文を特定します。与えられたタイトル、DOI、arXiv ID、またはPDFから、semantic-scholar（CS分野の論文ではdblpも）を使って論文を見つけます。一致候補が本当に曖昧な場合に限り、ユーザーに確認します。
2. 最も権威あるバージョンを特定します。references/bibliography-rules.md に従い、出版済みの版 > 最新のarXiv改訂版 > その他のプレプリントの順とします。DOIとarXiv IDの両方がある場合は、両方を記録します。
3. citekey（<firstauthor><year><topicword>、小文字）を選び、未使用であることを確認します。references.bib に存在せず、sota/papers/<citekey>/ フォルダーも存在しないことを確認します。
4. sota/papers/<citekey>/ を作成し、優先順位の高い権威ある合法な入手先から順に、フォールバック手順を通じて全文PDFを取得し、paper.pdf として保存します。(1) arXiv 論文の場合は arxiv MCP、(2) それ以外の場合は paper-search を使います。paper-search は、出版社／DOI経由のオープンアクセス → Unpaywall → グリーンOAリポジトリ（Europe PMC/PMC、CORE、OpenAIRE、Zenodo、HAL、SSRN、…）→ 最終手段としてSci-Hubの順にフォールバックします。取得したURLを metadata.yaml の pdf_source に記録します。PDFは読むためのコピーにすぎません。引用情報と権威あるバージョンは、PDFの取得元ではなく、必ず学術系 MCP（DOIで照合）に基づきます。最終手段でも何も得られない場合は、作業を停止してフォルダーを削除し、候補を sota/queue.md に unresolvable-via-mcp の判定とともに記録します。要旨だけを使ったダイジェスト作成は禁止です。
5. 論文全体を読みます。要旨だけでなく、PDFを最初から最後まで読みます。
6. sota/README.md のセクション順に厳密に従って synthesis.md を作成します。数値と引用はすべてPDFと照合して検証します。
7. MCPから取得した情報を元に、references/bibliography-rules.md に従って相互確認したうえで、BibTeXエントリーを作成し、references.bib のSOTAセクションに追加します。記憶に基づいてフィールドを記載してはいけません。
8. semantic-scholar経由で引用情報を取得します。被引用文献と引用文献の両方を取得し、すべてではなく関連するものを選びます。sota/README.md のスキーマにあるすべてのフィールドを含め、必須の verified: ブロックも含めて metadata.yaml を作成します。すでにSOTAに含まれる論文にはcitekeyを使い、それ以外には外部IDを使います。
9. sota/index.md にステータス digested で行を追加します。
10. cites／cited_by と統合の「Citation leads」セクションから、対象範囲内の候補を根拠情報とともに pending として sota/queue.md に追加します。
11. プロジェクトのルートから make check を実行し、報告された問題をすべて修正します。

ルール

• すべて完了するか、何も行わないかのどちらかです。どの手順も完了できない場合は、途中までのフォルダーを元に戻し、その論文を queue.md に記録します。
• 論文1本 = フォルダー1つ = Bibエントリー1件 = インデックス行1件（1:1:1）。
• ダイジェスト作成中に他の論文のフォルダーで許される編集は、その論文の cites／cited_by リストにある外部IDをcitekeyに置き換えることだけです。

完了条件

• sota/papers/<citekey>/ に paper.pdf、synthesis.md、metadata.yaml がある
• references.bib と sota/index.md に、それぞれエントリが1件だけ追加されている
• make check が成功する