drugbank-search

DrugBank 検索

Valyu のセマンティック検索 API を利用した自然言語クエリで、作用機序、相互作用、標的、薬理学など、DrugBank の薬剤情報データベース全体を検索できます。

このスキルが強力な理由

• API パラメーターの解析は不要：自然言語のクエリをそのまま渡すだけです。複雑な検索パラメーターを組み立てる必要はありません。
• セマンティック検索：キーワードの一致だけではなく、クエリの意味を理解します。
• 全文にアクセス：作用機序、相互作用、標的など、薬剤情報全体を取得できます。
• 画像リンク：分子構造やデータの可視化を含みます。
• 包括的なカバレッジ：DrugBank の薬剤データ全体にアクセスできます。

要件

1. Node.js 18+（組み込みの fetch を使用）
2. https://platform.valyu.ai から取得した Valyu API キー（10 ドル分の無料クレジット）

重要：スクリプトパスの解決

このドキュメント内の scripts/search コマンドは、このスキルのインストールディレクトリからの相対パスです。

コマンドを実行する前に、次の方法でスクリプトの場所を確認してください。

DRUGBANK_SCRIPT=$(find ~/.claude/plugins/cache -name "search" -path "*/drugbank-search/*/scripts/*" -type f 2>/dev/null | head -1)

その後、すべてのコマンドでフルパスを使用してください。

$DRUGBANK_SCRIPT "ACE inhibitors" 15

API キーの設定手順

検索を実行して "setup_required": true が返された場合は、次の手順に従ってください。

1. ユーザーに API キーを尋ねます。 「DrugBank を検索するには、Valyu API キーが必要です。https://platform.valyu.ai から無料で取得できます（10 ドル分のクレジット付き）。」

2. ユーザーからキーを受け取ったら、次を実行します。

   scripts/search setup <api-key>
   

3. 元の検索を再試行します。

このスキルを使用する場面

• 包括的な薬剤情報の検索
• 薬物相互作用や副作用の調査
• 標的の特定と検証
• 作用機序の研究
• 薬物動態と薬力学の研究
• 薬物代謝と有害事象データの調査

出力形式

{
  "success": true,
  "type": "drugbank_search",
  "query": "ACE inhibitors",
  "result_count": 10,
  "results": [
    {
      "title": "Drug Name",
      "url": "https://drugbank.com/...",
      "content": "Drug information, mechanism, interactions...",
      "source": "drugbank",
      "relevance_score": 0.95,
      "images": ["https://example.com/structure.png"]
    }
  ],
  "cost": 0.025
}

結果の処理

jq を使う場合

# Get drug names
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].title'

# Get URLs
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].url'

# Extract full content
scripts/search "query" 10 | jq -r '.results[].content'

よくある使用例

薬剤情報

# Find drug details
scripts/search "metformin pharmacokinetics" 50

薬物相互作用

# Search for interactions
scripts/search "CYP3A4 inhibitor drug interactions" 20

作用機序の調査

# Find mechanism data
scripts/search "selective serotonin reuptake inhibitors mechanism" 15

標的の特定

# Search for drug targets
scripts/search "drugs targeting BCR-ABL fusion protein" 25

エラー処理

すべてのコマンドは success フィールドを含む JSON を返します。

{
  "success": false,
  "error": "Error message"
}

終了コード：

• 0 - 成功
• 1 - エラー（詳細は JSON を確認してください）

API エンドポイント

• ベース URL：https://api.valyu.ai/v1
• エンドポイント：/search
• 認証：X-API-Key ヘッダー

アーキテクチャ

scripts/
├── search          # Bash wrapper
└── search.mjs      # Node.js CLI

Node.js に組み込まれている fetch() を使用して API を直接呼び出すため、外部依存関係はありません。

プロジェクトへの追加

AI プロジェクトを構築していて、DrugBank Search をアプリケーションに直接統合したい場合は、Valyu SDK を使用してください。

Python との統合

from valyu import Valyu

client = Valyu(api_key="your-api-key")

response = client.search(
    query="your search query here",
    included_sources=["valyu/valyu-drugbank"],
    max_results=20
)

for result in response["results"]:
    print(f"Title: {result['title']}")
    print(f"URL: {result['url']}")
    print(f"Content: {result['content'][:500]}...")

TypeScript との統合

import { Valyu } from "valyu-js";

const client = new Valyu("your-api-key");

const response = await client.search({
  query: "your search query here",
  includedSources: ["valyu/valyu-drugbank"],
  maxResults: 20
});

response.results.forEach((result) => {
  console.log(`Title: ${result.title}`);
  console.log(`URL: ${result.url}`);
  console.log(`Content: ${result.content.substring(0, 500)}...`);
});

統合例と SDK リファレンスの詳細は、Valyu のドキュメントをご覧ください。