cell-figure-guide

Cell 图表准备指南

概述

本指南提供向 Cell 及其他 Cell Press 期刊（如 Cell Stem Cell、Cell Reports、Molecular Cell）投稿时准备图表的完整规范。Cell Press 对图表有严格要求，并实施严格的图像完整性政策。

官方参考资料：https://www.cell.com/information-for-authors/figure-guidelines

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分辨率要求

图像类型	最低分辨率	备注
彩色／灰度照片	300 DPI	按目标印刷尺寸计算
黑白图像	500 DPI	按目标印刷尺寸计算
线条图（图表、示意图）	1,000 DPI	按目标印刷尺寸计算

重要：所有分辨率测量均以目标印刷尺寸为准，而非整页尺寸。

验证分辨率

from PIL import Image

def check_cell_resolution(image_path, image_type='color'):
    """Check if image meets Cell journal resolution requirements.

    Args:
        image_path: Path to the image file
        image_type: 'color' (300 DPI), 'bw' (500 DPI), or 'lineart' (1000 DPI)
    """
    min_dpi = {'color': 300, 'bw': 500, 'lineart': 1000}
    required = min_dpi.get(image_type, 300)

    img = Image.open(image_path)
    dpi = img.info.get('dpi', (72, 72))

    print(f"Image type: {image_type}")
    print(f"Required DPI: {required}")
    print(f"Actual DPI: {dpi[0]} x {dpi[1]}")

    if dpi[0] >= required:
        print("PASS: Resolution meets Cell requirements")
    else:
        print(f"FAIL: Need at least {required} DPI, got {dpi[0]}")

    return dpi[0] >= required

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文件格式

首选格式

格式	最适用于	备注
TIFF	位图、灰度图、彩色图像	使用 LZW 压缩以减小文件大小
PDF	任何类型的图表	普遍接受
EPS	矢量图像（图表、示意图）	保持可缩放性

也接受

• JPEG、CDX 文件

文件大小

• 单个文件：最大 20 MB

投稿说明

• 初次投稿：图表可嵌入稿件或单独上传
• 最终制作：需提供单独的高分辨率文件

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图表尺寸和规格

双栏版式期刊（Cell、Molecular Cell 等）

布局	宽度
1 栏	85 mm（3.35 in）
1.5 栏	114 mm（4.49 in）
全宽	174 mm（6.85 in）

三栏版式期刊

布局	宽度
1 栏	55 mm（2.17 in）
2 栏	114 mm（4.49 in）
全宽	174 mm（6.85 in）

其他 Cell Press 期刊（Chem、Joule、Matter 等）

布局	宽度
1 栏	112 mm（4.41 in）
全宽	172 mm（6.77 in）

所有图表必须能放在一张 8.5" x 11" 的页面上。

Python：设置 Cell 图表尺寸

import matplotlib.pyplot as plt

# Cell Press figure widths in inches
CELL_WIDTHS = {
    '2col_single':   85 / 25.4,   # 3.35 in
    '2col_1.5':      114 / 25.4,  # 4.49 in
    '2col_full':     174 / 25.4,  # 6.85 in
    '3col_single':   55 / 25.4,   # 2.17 in
    '3col_double':   114 / 25.4,  # 4.49 in
    '3col_full':     174 / 25.4,  # 6.85 in
}

def create_cell_figure(layout='2col_single', aspect_ratio=0.75):
    """Create a Matplotlib figure sized for Cell Press journals."""
    width = CELL_WIDTHS[layout]
    height = width * aspect_ratio

    fig, ax = plt.subplots(figsize=(width, height))
    fig.set_dpi(300)

    return fig, ax

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色彩模式

• 以 RGB 色彩空间提交
• 期刊会在印刷制作时转换为 CMYK
• RGB 可在在线浏览时保留更明亮的色彩

from PIL import Image

def convert_to_rgb_for_cell(image_path, output_path):
    """Convert image to RGB for Cell Press submission."""
    img = Image.open(image_path)
    if img.mode == 'CMYK':
        img = img.convert('RGB')
        print("Converted from CMYK to RGB")
    elif img.mode != 'RGB':
        img = img.convert('RGB')
        print(f"Converted from {img.mode} to RGB")
    img.save(output_path)
    return output_path

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字体要求

元素	字体	大小
主字体	Avenir（首选）、Arial、Helvetica	—
图中文字	—	印刷尺寸下约 7 pt
分面标签	—	粗体，大写字母

关键规则

• Adobe Illustrator 文件中必须嵌入所有字体
• 首选 Avenir；也可使用 Arial 或 Helvetica
• 所有图表分面中的字体用法必须一致

import matplotlib.pyplot as plt

def set_cell_fonts():
    """Configure Matplotlib for Cell Press figure fonts."""
    plt.rcParams.update({
        'font.family': 'sans-serif',
        'font.sans-serif': ['Avenir', 'Arial', 'Helvetica'],
        'font.size': 7,
        'axes.labelsize': 7,
        'axes.titlesize': 7,
        'xtick.labelsize': 6,
        'ytick.labelsize': 6,
        'legend.fontsize': 6,
    })

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标注规范

分面标签

• 大写字母：A、B、C、D……
• 粗体
• 位置：每个分面的左上角

标题

• 请勿在图表内放置标题——应将标题写在图注中
• 删除所有非理解图表所必需的标签；在图注中进行说明

import matplotlib.pyplot as plt
import string

def add_cell_panel_labels(fig, axes):
    """Add Cell-style uppercase bold panel labels."""
    if not hasattr(axes, '__iter__'):
        axes = [axes]

    for i, ax in enumerate(axes):
        label = string.ascii_uppercase[i]
        ax.text(-0.1, 1.1, label,
                transform=ax.transAxes,
                fontsize=8,
                fontweight='bold',
                va='top',
                ha='right',
                fontfamily='Arial')

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图像完整性与处理政策

严格禁止

• 在科学图像上使用 Photoshop 仿制图章／修复工具
• 对图像的任何部分进行选择性增强或修改
• 拼接来自不同实验的图像而不作明确说明
• 修饰凝胶／印迹图像以隐藏或修改数据

允许（须完整披露）

• 对整张图像统一调整亮度、对比度和色彩
• 对显微镜图像进行最低限度的图像处理（必须在 Methods 中说明）

必须遵守

• 必须在图例和 Methods 中说明单个颜色通道的修改
• 凝胶图像：移除的泳道必须清楚标记，并在图例中注明修改
• 编辑／审稿人要求时，必须提供未经处理的原始数据
• 必须透明、完整地说明所有处理步骤

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Python 快速入门：完整验证

from PIL import Image
import os

def validate_cell_figure(image_path, image_type='color', layout='2col_single'):
    """Full validation of a figure against Cell Press requirements."""
    img = Image.open(image_path)
    issues = []

    # 1. Resolution check
    min_dpi = {'color': 300, 'bw': 500, 'lineart': 1000}
    required_dpi = min_dpi.get(image_type, 300)
    dpi = img.info.get('dpi', (72, 72))
    if dpi[0] < required_dpi:
        issues.append(f"Resolution {dpi[0]} DPI below minimum {required_dpi} DPI for {image_type}")

    # 2. Color mode check
    if img.mode != 'RGB':
        issues.append(f"Color mode is {img.mode}; Cell requires RGB submission")

    # 3. File size check
    size_mb = os.path.getsize(image_path) / (1024 * 1024)
    if size_mb > 20:
        issues.append(f"File size {size_mb:.1f} MB exceeds 20 MB limit")

    # 4. Dimension check (width in mm)
    widths_mm = {
        '2col_single': 85, '2col_1.5': 114, '2col_full': 174,
        '3col_single': 55, '3col_double': 114, '3col_full': 174,
    }
    if layout in widths_mm and dpi[0] > 0:
        max_width_mm = widths_mm[layout]
        actual_width_mm = (img.size[0] / dpi[0]) * 25.4
        print(f"Width at current DPI: {actual_width_mm:.1f} mm (target: {max_width_mm} mm)")

    # Report
    print(f"=== Cell Figure Validation: {os.path.basename(image_path)} ===")
    print(f"Dimensions: {img.size[0]} x {img.size[1]} px")
    print(f"DPI: {dpi[0]} x {dpi[1]}")
    print(f"Color mode: {img.mode}")
    print(f"File size: {size_mb:.1f} MB")

    if issues:
        print(f"\nISSUES FOUND ({len(issues)}):")
        for issue in issues:
            print(f"  - {issue}")
    else:
        print("\nAll checks PASSED")

    return len(issues) == 0

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关键概念

按图像类型划分的分辨率等级

Cell Press 采用三级分辨率标准：彩色／灰度照片为 300 DPI，黑白图像为 500 DPI，线稿为 1,000 DPI。所有测量值均以预期印刷尺寸为准，而非任意放大的尺寸。这种分级方式可确保各类图像以适当的质量呈现。

Cell Press 栏宽体系

Cell Press 期刊会根据期刊类型采用不同的栏宽布局。双栏期刊（Cell、Molecular Cell）使用 85／114／174 mm 的栏宽。三栏期刊使用 55／114／174 mm 的栏宽。其他期刊（Chem、Joule）使用 112／172 mm 的栏宽。将图件调整到正确的栏宽，可避免不必要的缩放。

图像处理政策

Cell Press 执行生物医学出版领域最严格的图像完整性政策之一。明确禁止在科学图像上使用 Photoshop 的仿制图章／修复工具。任何单通道颜色调整都必须在图注和 Methods 部分中披露。

决策框架

What type of image are you preparing?
├── Color or grayscale photograph → 300 DPI minimum
│   ├── Micrograph → TIFF (LZW compression)
│   └── Clinical image → TIFF or PDF
├── Black-and-white image → 500 DPI minimum
│   └── High-contrast micrograph → TIFF
├── Line art (graph, diagram) → 1,000 DPI minimum
│   ├── Vector source → Export as PDF or EPS
│   └── Raster source → Export TIFF at 1,000 DPI
└── Which journal layout?
    ├── Cell, Molecular Cell → 2-column (85/114/174 mm)
    ├── Cell Reports → 3-column (55/114/174 mm)
    └── Chem, Joule, Matter → Single/full (112/172 mm)

场景	格式	分辨率	宽度
荧光显微图像	TIFF（LZW）	300 DPI	期刊指定栏宽
Western blot	TIFF	500 DPI	单栏（85 mm）
柱状图或散点图	PDF 或 EPS	1,000 DPI（栅格化时）	因数据密度而异
凝胶电泳	TIFF	500 DPI	多泳道时为整栏宽度
通路示意图	PDF 或 EPS	矢量	整栏宽度（174 mm）

最佳实践

1. 对 TIFF 文件使用 LZW 压缩：Cell 接受使用 LZW 压缩的 TIFF 文件，这种压缩可显著减小文件体积而不损失质量，有助于将文件大小控制在 20 MB 限制以内
2. 从图件中移除标题：Cell Press 要求图件标题仅出现在图注中，不得置于图件内部。提交前请移除所有嵌入的标题
3. 将 Avenir 用作主要字体：虽然也接受 Arial 和 Helvetica，但 Avenir 是 Cell Press 首选的字体。使用该字体表明熟悉期刊规范
4. 在 AI 文件中嵌入所有字体：Adobe Illustrator 文件必须完整嵌入字体。缺少字体会导致制作过程中出现渲染错误
5. 披露所有凝胶图像修改：移除的泳道必须在图件中明确标记，并在图注中说明。未披露的修改可能导致稿件被拒
6. 根据图像类型匹配分辨率：线稿不要使用 300 DPI（需要 1,000 DPI），照片也不要使用 1,000 DPI（会浪费文件空间）。请根据内容类型选择相应的分辨率等级
7. 保留未经处理的原始数据：Cell Press 可能在审稿期间或发表后要求提供原始数据。请将所有原始文件与处理后的版本一并存档

常见误区

1. 对所有图像类型都使用 300 DPI：线稿需要 1,000 DPI；黑白图像需要 500 DPI。对这些类型使用 300 DPI 会导致边缘锯齿化
   • 如何避免：查看三级分辨率表，并在导出前根据图像类型选择合适的分辨率
2. 对科学图像使用仿制／修复工具：Cell Press 明确禁止在科学数据上使用 Photoshop 仿制和修复工具
   • 如何避免：仅对整张图像统一调整亮度／对比度；在 Methods 中记录所有处理过程
3. 将标题放在图内：Cell Press 要求所有标题都放在图注中，而不是嵌入图内
   • 如何避免：检查每个图版，并删除所有应放在图注中的文字
4. 文件大小超过 20 MB：未压缩的 TIFF 文件经常会超出限制
   • 如何避免：保存 TIFF 文件时使用 LZW 压缩；上传前检查文件大小
5. 期刊对应的栏宽不正确：对 3 栏期刊使用 2 栏宽度（反之亦然）会导致图像被重新缩放
   • 如何避免：确认目标 Cell Press 期刊，并使用正确的栏宽表
6. 未披露单通道颜色调整：未披露就更改单个颜色通道违反 Cell Press 政策
   • 如何避免：在图例和 Methods 部分中记录任何单通道修改

投稿前检查清单

向 Cell 投稿图件前，请确认：

• 彩色／灰度图像分辨率为 300 DPI 或更高
• 黑白图像分辨率为 500 DPI 或更高
• 线稿分辨率为 1,000 DPI 或更高
• 文件格式为 TIFF（LZW）、PDF 或 EPS
• 每个文件小于 20 MB
• 颜色模式为 RGB
• 字体为 Avenir、Arial 或 Helvetica，字号约为 7 pt
• 图版标签为大写粗体（A、B、C）
• 图内没有标题（请使用图注）
• AI 文件中已嵌入所有字体
• 科学图像未使用仿制／修复工具
• 所有亮度／对比度调整均应用于整张图像
• 凝胶泳道的删除位置已在图例中清楚标明
• 已在 Methods 中说明处理细节
• 已保留未经处理的原始数据

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参考资料

• Cell Press 图件指南：https://www.cell.com/information-for-authors/figure-guidelines
• Cell Press 数字图像指南：https://www.cell.com/matter/figureguidelines
• Cell Press 图像完整性政策：https://www.cell.com/cell/image-integrity