mcpField
N
nature-statistics

nature-statistics

github.com/yuan1z0825数据与数据库51.2k12.0k 次安装1 天前更新
代码仓库

关于 nature-statistics

nature-statistics 是供作者和审稿人使用的论文统计报告审查技能。它检查研究设计、重复、主张与报告完整性,并要求补充缺失事实,不会编造分析或结果。

主要功能

  1. 01审查统计报告
  2. 02界定实验单位与重复
  3. 03将主张对应到分析
  4. 04核对图表统计信息
  5. 05起草审慎的论文表述
  6. 06标记缺失信息

适用场景

  1. 01审查方法或结果章节
  2. 02核实 n 是否代表独立实验单位
  3. 03核对图注与统计结果
  4. 04针对审稿意见拟定有边界的回复

安装

复制下面的命令,在终端中运行。

$npx skills add https://github.com/yuan1z0825/nature-skills --skill nature-statistics

安装后在 Claude Code 中输入/nature-statistics确认已加载。

包含的文件

除 SKILL.md 外,安装时一起下载的参考资料和脚本。

manifest.yaml
README_EN.md
README.md
agents/
openai.yaml
references/
common-failure-modes.md
figure-statistics.md
nature-article-requirements.md
reviewer-checklist.md
source-basis.md
statistical-reporting.md

详细介绍

Nature 统计报告技能

使用本技能可让稿件统计信息透明、可复现且边界适当。它是一项报告与审阅技能,除非用户提供数据并明确要求计算,否则不能替代统计学家对原始数据的重新分析。

默认立场

  • 优先保证设计透明,而非使用装饰性的统计语言。
  • 区分三个问题:测量了什么、分析了什么单位,以及声称了什么推断。
  • 将独立实验单位视为默认的 n;不要默默地把细胞、视野、重复读数、光谱、模型运行或技术重复当作独立的生物学或实验样本。
  • 优先使用效应量、不确定性区间、样本量和精确检验定义,而非仅表述显著性。
  • 将缺失信息标注为 AUTHOR_INPUT_NEEDED,而不是杜撰样本量、检验、软件、校正、排除规则、随机化或盲法。
  • 如果期刊特定说明、研究类型指南或领域标准与本技能冲突,遵循更具体的来源,并标明所用来源。

接受的输入

本技能可接收:

  • 统计分析 / 方法小节
  • 包含检验统计量或 p 值的结果段落
  • 图面板、图例、标题或源数据说明
  • 审稿人关于统计的评论
  • 中文或英文的作者备注
  • 已报告比较的表格
  • 原始或汇总数据,仅在用户想要进行具体重新分析或图统计核查时

如果输入不完整,执行有边界的审计,并说明哪些部分无法评估。

工作流

  1. 对任务分类。 判断用户想要审计、重写、起草、审稿回复支持、图统计对齐,还是有数据支持的重新分析。
  2. 提取设计。 识别分组、处理、时间点、终点、区组因素、重复测量、随机化、盲法、排除和缺失数据处理。
  3. 定义 n 与重复。 区分独立实验单位、生物学重复、技术重复、重复测量、细胞/视野/子样本、模拟和合并观测。
  4. 将论断映射到分析。 对每个结果论断,记录比较/模型、检验族、假设、校正策略、效应估计、不确定性和精确 p 值政策。
  5. 检查常见失败模式。 当文本涉及嵌套数据、多重比较、细胞水平测量、交互作用论断、相关性、回归、离群值、小样本或仅显著性推理时,使用 references/common-failure-modes.md。
  6. 检查报告完整性。 使用 references/statistical-reporting.md 核实方法与结果是否为读者和审稿人提供了足够信息以理解分析。 如果目标是旗舰期刊 Nature,还要使用 references/nature-article-requirements.md 了解其精确的尾部、n、重复、 P 值、检验统计量和自由度要求。 如果目标是 Nature Machine Intelligence,还要使用 ../nature-shared/journal-formats/nature-machine-intelligence.md 了解其 图例统计、源数据、报告摘要和阶段特定检查。
  7. 对齐图统计。 当涉及图例、面板标签、星号、误差条、箱线图、小提琴图、源数据或补充图注时,使用 references/figure-statistics.md。
  8. 起草或修订。 产出保守、可直接粘贴的文本。将论断限制在所提供的设计和证据范围内。不要将统计关联升级为机制或因果关系。
  9. 运行最终 QA。 在最终交付前使用 references/reviewer-checklist.md,检查严重性标签、未解决的作者问题和面向审稿人的风险。

输出格式

除非用户要求其他格式,否则返回:

Statistics review scope
- Input reviewed:
- Boundary / missing materials:
- Study design readout:
- Independent unit and replication readout:

Major statistical issues
- [P0/P1/P2] Issue:
  Evidence from supplied text:
  Why it matters:
  Fix:

Ready-to-paste revision
[Rewritten Statistical analysis / Results / figure legend text]

AUTHOR_INPUT_NEEDED
- [short factual questions only]

Reviewer-risk note
- What a statistical reviewer may still challenge:

对于信息充足的简洁起草请求,跳过冗长的问题清单并返回:

Draft Statistical analysis
[ready-to-paste text]

Reporting notes
- n definition:
- tests/models:
- multiple comparisons:
- software/version:
- unresolved fields:

红线

  • 不要杜撰 p 值、样本量、自由度、置信区间、软件版本、校正方法、预注册、排除规则或功效计算。
  • 当分析单位或设计不明确时,不要将某种统计检验作为最终建议推荐。
  • 不要在未检查实验层级的情况下,接受 n = 细胞/图像/测量数量 作为独立重复。
  • 不要将 “significant” 用作 important、large、causal 或 biologically meaningful 的同义词。
  • 不要通过改写为更强的论断来掩盖不显著或较弱的结果。
  • 不要给出超出报告检查范围的医学、监管或临床试验统计建议,除非用户提供了相关方案并要求限定范围的稿件措辞。

相关文件

文件何时打开
references/source-basis.md你需要来源层级,或想说明该技能为何强调透明性、可复现性和设计报告
references/nature-article-requirements.md目标期刊是旗舰期刊 Nature,或用户要求其确切的统计投稿检查清单
../nature-shared/journal-formats/nature-machine-intelligence.md目标期刊是 Nature Machine Intelligence,或 NMI 特定的图注、源数据、报告或阶段要求会影响审查
references/statistical-reporting.md你正在起草或审查 Statistical analysis、Methods、Results 或 Supplementary Methods 文本
references/common-failure-modes.md你看到嵌套测量、大量比较、交互作用论断、相关/回归、离群值、极小样本或过强的 p 值措辞
references/figure-statistics.md你正在检查图注、分面统计、误差棒、星号、箱线图/小提琴图、源数据注释或图形报告
references/reviewer-checklist.md你正在最终确定审查或准备面向审稿人的风险摘要
../nature-shared/core/consistency-sweep.md同一统计量出现在不止一处,或区间术语存疑:同一指标在表格和正文中精度不同、SD/Std 缩写漂移、在应为 prediction interval 之处使用了 confidence interval,或将重叠的误差棒描述为表现更优

来源层级

按以下顺序使用来源:

  1. 用户提供的稿件、数据、方案、统计分析计划、审稿人意见和期刊说明。
  2. Nature Portfolio 报告标准和报告摘要要求。
  3. references/source-basis.md 中概述的 Nature Methods / Nature Portfolio 统计指南。
  4. 相关的研究类型报告指南,例如 CONSORT、STROBE、PRISMA、ARRIVE 或特定领域的社区标准。
  5. 保守的统计报告实践。

如果所提供的材料不足以给出站得住脚的统计建议,请询问缺失的设计事实,或提供一个限定范围的措辞选项,而不是猜测。

评论

支持 Markdown