Skills
收录 97,222 个为 Agent 打包的专项能力与操作指引,复制一行命令即可安装。
数据与数据库
通过 idc-index Python 客户端查询和下载 NCI Imaging Data Commons(IDC)癌症影像与病理数据集。无需认证:pip wheel 内置 parquet 索引,SQL 通过 DuckDB 在本地运行,DICOM 下载经 s5cmd 从公共 S3/GCS 存储桶流式传输。用 sql_query() 进行 DuckDB 队列选择,用 get_collections/get_patients/get_dicom_studies/get_dicom_series 进行分层浏览,用 download_from_selection() 下载,用 get_viewer_URL() 获取 OHIF/Slim 链接。本地 DICOM 读取请使用 pydicom-medical-imaging;全切片病理预处理请使用 histolab。
使用 DSP System Toolbox 的 System object 设计和实现自适应滤波器。适用于自适应滤波、系统辨识、噪声消除、回声消除、主动噪声控制 (ANC)、信道均衡、逆系统辨识或自适应预测。涵盖 dsp.LMSFilter、dsp.RLSFilter、dsp.FilteredXLMSFilter、dsp.FrequencyDomainAdaptiveFilter、dsp.AffineProjectionFilter、dsp.BlockLMSFilter、dsp.AdaptiveLatticeFilter、dsp.FastTransversalFilter、maxstep(),以及自适应滤波问题的算法选择。替代已弃用的 adaptfilt.* 对象(已于 R2020a 移除)。
当用户要求优化、导出、部署服务、压缩或加速 ML 推理时,应使用本技能。主动在以下情况激活:(1) 延迟、吞吐量、p95/p99、批处理、并发、KV cache、显存或成本问题;(2) 量化 INT8/INT4、GPTQ、AWQ、bitsandbytes、剪枝、稀疏化、蒸馏;(3) ONNX export、ONNX Runtime、TensorRT、TorchScript、torch.compile、XLA、OpenVINO、Core ML、TFLite;(4) Triton、TorchServe、TF Serving、BentoML、Seldon、KServe 配置;(5) 边缘部署、CPU/GPU/TPU/Inferentia 服务。提供:硬件感知的推理优化和安全的基准测试。
从 Smartlead 活动中拉取回复,使用 Claude 将每条回复分类为 positive/neutral/negative/OOO/bounce/unsubscribe,并报告正面回复率 —— 冷邮件的关键指标。当用户想知道活动是否真的有效(不只是获得回复,而是获得正确的回复)时使用。触发词包括 "score my replies"、"how's campaign X doing"、"positive reply rate"、"is this campaign working"。
通过 webhook、Zapier/Make、原生集成和自定义 API 管道连接销售工具——CRM 同步、事件触发、数据映射和错误处理。当 CRM 数据没有从 Mailshake/Apollo/Salesloft 同步、webhook 事件未触发或到达时格式错误、Zapier/Make 自动化失败或跳过记录、工具之间数据重复或缺失,或原本正常工作的集成突然中断时使用。不要用于 Qwilr 专用自动化(请用 /sales-qwilr-automation)、通用 CRM 平台配置(请用 /sales-apollo 或 /sales-salesloft)或营销自动化流程(请用 /email-sequence)。
Word / PDF / PPT 文档解析与数据分析引擎。覆盖三类文件格式的全量提取、表格数值化、图表理解与跨文档汇总分析。**遇到以下任一情况就主动使用本 skill**:①用户上传或指定了 .docx / .doc / .pdf / .pptx / .ppt 文件并要求分析、提取或统计其中内容;②用户出现触发词:Word 分析 / PDF 解析 / PPT 提取 / 文档分析 / 报告解析 / 幻灯片分析 / 发票提取 / 合同分析 / 文档统计 / 错别字 / 语病 / 字号检查 / 简历分析 / 多文档对比;③任务涉及从文档中提取表格、数值、图表、格式(颜色/高亮/字号)、组织架构、时间线等结构化信息。仅不用于:Excel/CSV 数据分析(使用 sn-da-excel-workflow)、纯图片分析(使用 sn-da-image-caption)。
用于细胞外电生理的统一 Python 框架。加载 20 多种格式(SpikeGLX、OpenEphys、NWB、Intan、Maxwell、Blackrock),预处理,通过一个 API 运行 10 多种分选器(Kilosort4、SpykingCircus2、Tridesclous、MountainSort5),计算质量指标(SNR、ISI、放电率),比较分选器,导出 NWB/Phy。适用于与格式无关的多分选器工作流。Neuropixels 专用的 PSTH/解码请使用 neuropixels。
使用 geniml Python 包对基因组区间数据(BED 文件)进行机器学习——区域嵌入(Region2Vec)、区域与元数据联合嵌入(BEDspace/StarSpace)、单细胞 ATAC-seq 嵌入(scEmbed)、共识峰集/宇宙(build-universe)、分词、BEDshift 随机化,以及 BBClient/BEDbase 缓存。适用于训练或使用区域/细胞嵌入、对 scATAC-seq 进行聚类、从 BED 集合构建分词宇宙,或任何针对基因组区域的机器学习/特征学习任务。不适用于单纯的区间运算(重叠/相交/合并计数)——那是 gtars,而非 geniml。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。
使用 GeoPandas Python 库读取、写入和分析地理空间矢量数据(shapefile、GeoJSON、GeoPackage),支持 PostGIS,并与 matplotlib、folium 和 cartopy 集成。适用于空间分析和几何操作——缓冲区分析、数据集之间的空间连接与叠置、边界融合、裁剪、面积与距离计算、坐标系统重投影、分级色彩地图绘制,或矢量文件格式之间的转换。这针对表格型矢量数据;对于栅格/卫星/DEM 工作、光谱指数(NDVI)或地球观测上的空间机器学习,请优先使用 geomaster 技能。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。
使用 gtars(databio)运行高性能基因组区间分析,这是一个带 Python 绑定的 Rust 工具包——也是 geniml ML 库对性能要求苛刻的后端。适用于计算 BED 区域集之间的重叠/jaccard/覆盖度、用 IGD 索引区间、生成 uniwig 累积/覆盖轨迹、为 ML 对基因组区域进行分词、将单细胞片段拆分为伪块,或计算 GA4GH refget 序列摘要。不适用于训练区域嵌入(请使用 alterlab-geniml)或非基因组空间连接(请使用 alterlab-geopandas)。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。
查询 GTEx(Genotype-Tissue Expression)门户 v2 REST API,获取组织特异性基因表达(54 种人体组织的中位 TPM)、表达 QTL(eQTL)和剪接 QTL(sQTL)。适用于检查某基因在哪些组织中表达、通过 eQTL 找出某非编码/GWAS 变异调控的基因,或解读变异在各组织中的调控效应。不适用于经整理的表型-变异关联(请使用 alterlab-gwas)、群体等位基因频率或变异约束(请使用 alterlab-gnomad),或基因/转录本结构和 ID 映射(请使用 alterlab-ensembl)。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。
通过 REST API 直接访问 KEGG(仅限学术用途),用于通路分析、基因到通路与化合物到通路的映射、代谢反应、KEGG Orthology (KO)、药物-药物相互作用以及 ID 转换。适用于通过原始 HTTP/REST 查询 KEGG 通路、将基因/化合物映射到代谢图,或运行 KEGG 通路富集时;对于蛋白质-蛋白质相互作用网络,优先使用 alterlab-string-db;对于蛋白质序列与注释,优先使用 alterlab-uniprot;对于跨越多个数据库的 Python 工作流,优先使用 alterlab-bioservices。隶属于 AlterLab Academic Skills 套件。
使用 Latch SDK 在 LatchBio 平台上构建和部署生物信息学流水线——用 @workflow/@task 装饰器编写工作流、处理 LatchFile/LatchDir I/O、注册无服务器工作流、配置 CPU/GPU 任务资源、在 Latch Registry 中组织数据,以及封装 Nextflow/Snakemake 流水线。适用于开发或部署 Latch SDK 工作流、为任务资源设定规格、使用 Registry,或将 Nextflow/Snakemake 生物信息学流水线移植到 LatchBio 上。不适用于 DNAnexus(dxpy/dx CLI)或通用 Flyte。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。
一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。
