Skills

A

alterlab-imaging-data-commons

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 idc-index Python 包查询并下载 NCI Imaging Data Commons（IDC）的公开癌症影像数据，可按元数据筛选、在浏览器中可视化并检查许可证，无需身份验证。适用于获取大规模放射学（CT、MR、PET）或数字病理 DICOM 数据集，用于 AI/ML 训练或癌症影像研究时使用。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。

A

alterlab-interpro

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

查询 EMBL-EBI InterPro REST API，获取整合自成员数据库（Pfam、PANTHER、PRINTS、SMART、SUPERFAMILY、CDD、ProSite、NCBIfam 等）的蛋白家族、结构域和功能位点注释。适用于预测蛋白功能、分析或比较结构域架构、按家族或同源超家族对蛋白分类、解析 Pfam/InterPro 登录号，或将蛋白的特征序列映射到 GO 术语时使用。不用于获取原始 UniProt 条目/FASTA 或 AlphaFold 三维结构。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。

A

alterlab-lamindb

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 LaminDB 管理、注释和追踪生物数据。LaminDB 是一个开源的 FAIR 数据框架，使数据集可查询、带版本且可复现。适用于登记或查询生物数据集（scRNA-seq、空间组学、流式细胞术）、依据本体（基因、细胞类型、疾病、组织）验证和整理数据、追踪数据血缘与计算工作流、构建数据湖仓，或与 Nextflow、Snakemake、W&B、MLflow 对接集成时使用。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。

A

alterlab-metabolomics-wb

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

通过 REST API 访问 NIH Metabolomics Workbench（4,500+ 项公开研究），查询代谢物、RefMet 标准化命名、MS/NMR 数据、m/z 质量搜索以及研究元数据。适用于检索公开代谢组学研究数据、使用 RefMet 标准化代谢物名称、运行 m/z 查询，或进行生物标志物发现。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-molfeat

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 molfeat 为机器学习对分子进行特征化——ECFP/MACCS/MAP4 指纹、RDKit 与 Mordred 理化描述符、药效团与形状描述符，以及预训练嵌入（ChemBERTa、ChemGPT、CheMeleon），以 scikit-learn transformer 形式提供，可将 SMILES 转换为特征向量。适用于将分子转换为可用于 QSAR/QSPR 或虚拟筛选的 ML 特征矩阵，或对指纹与描述符、嵌入表示进行基准比较；若要在这些特征上训练模型和运行 MoleculeNet 基准，请优先使用 alterlab-deepchem；若需底层指纹或描述符原语，请优先使用 alterlab-rdkit。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。

A

alterlab-networkx

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 NetworkX 在 Python 中创建、分析并可视化复杂网络与图。适用于处理网络/图数据结构、分析实体间关系、计算图算法（最短路径、中心性、聚类）、检测社区、生成合成网络或可视化拓扑时——可用于社交、生物、交通、引用以及任何成对关系网络。这是经典图分析，而非深度学习——若要训练图神经网络（GCN/消息传递、Cora 类数据上的节点/边/图分类），请改用 alterlab-torch-geometric。隶属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-neuropixels

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 SpikeInterface 分析 Neuropixels 1.0/2.0 细胞外电生理数据——加载 SpikeGLX/Open Ephys 记录、预处理与运动校正、运行 Kilosort4 尖峰分选、计算质量指标、应用 Allen/IBL 整理流程，并进行 AI 辅助的目视检查。适用于处理神经记录、尖峰分选或细胞外电生理数据，或用户提到 Neuropixels、SpikeGLX、Open Ephys、Kilosort、质量指标或单元整理时使用。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。

A

alterlab-pathml

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 PathML 运行完整的计算病理工作流——跨 160+ 种切片格式的全切片图像（WSI）分析、多重免疫荧光（CODEX、Vectra、MERFISH）、细胞核分割/分类（HoVer-Net、HACTNet）、组织与细胞图构建、HDF5 数据集管理，以及在病理数据上训练深度学习模型。适用于用户构建端到端深度学习病理流水线、分析多重或空间蛋白组学切片，或分割细胞核。若只需轻量级 H&E 切片预处理、组织掩膜，或普通的 Random/Grid/Score 瓦片提取，请改用 alterlab-histolab。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-pennylane

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 PennyLane 训练并微分量子电路——一个硬件无关的量子机器学习框架，支持自动微分以及与 PyTorch/JAX 集成。适用于通过梯度训练量子电路（parameter-shift、backprop、adjoint）、构建混合量子-经典模型或量子神经网络，或运行可微的变分算法（VQE、QAOA）。若面向 IBM Quantum 硬件与 Qiskit Runtime，请改用 alterlab-qiskit；若面向 Google Quantum AI 或 NISQ 电路，请改用 alterlab-cirq；若研究开放系统 Lindblad/master-equation 动力学，请改用 alterlab-qutip。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-pymc

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 PyMC 6 与 ArviZ 1.x 进行贝叶斯建模和概率编程——层次模型、MCMC（通过 PyMC、nutpie、NumPyro 或 BlackJAX 实现 NUTS）、变分推断、PSIS-LOO 模型比较，以及先验/后验预测检验。适用于拟合贝叶斯或层次模型、估计后验与可信区间、诊断发散、R-hat 或 ESS，运行概率推断，或用 LOO 比较模型（WAIC 已在 ArviZ 1.x 中移除）。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-pysam

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 pysam（htslib 绑定）在 Python 中读写基因组比对与变异文件——SAM/BAM/CRAM 比对、VCF/BCF 变异、FASTA/FASTQ 序列，以及区域提取和逐碱基覆盖度/pileup。适用于编写解析、过滤、索引或计算 BAM/CRAM/VCF 文件覆盖度的 NGS 数据处理流水线脚本。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-rdkit

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

提供 RDKit 化学信息学工具包，用于低层、细粒度的分子基元——SMILES/SDF 解析、描述符（MW、LogP、TPSA）、指纹、子结构/SMARTS 搜索、2D/3D 坐标生成、相似性和反应处理。当自定义净化、专用指纹或描述符算法、反应枚举或构象生成需要直接 API 控制时使用；若需要在 RDKit 之上的高层 pandas 友好封装，优先使用 alterlab-datamol；若要将分子转换为 ML 特征向量，优先使用 alterlab-molfeat。属于 AlterLab Academic Skills 套件的一部分。

A

alterlab-scanpy

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 Scanpy 在 AnnData 上运行标准的单细胞 RNA-seq 分析流水线——QC 过滤、归一化、降维（PCA、UMAP、t-SNE）、Leiden/Louvain 聚类、标记基因/差异表达、PAGA 轨迹以及绘图。适用于通过聚类、细胞类型注释、DE 或拟时序工作流分析 scRNA-seq 数据；若要构建或读取 .h5ad 数据结构本身（layers、obs/var、拼接、backed 模式），请改用 alterlab-anndata；若要根据 spliced/unspliced 计数计算 RNA 速率，请改用 alterlab-scvelo。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-scvelo

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 scVelo 在单细胞 RNA-seq 数据上运行 RNA 速率分析——根据 spliced/unspliced mRNA 动态估计细胞状态转变、推断轨迹方向、计算潜时并识别驱动基因。适用于为轨迹添加方向性，或根据 spliced/unspliced 层（velocyto/STARsolo 输出）研究分化动态；若需通用的 QC、聚类、UMAP 和差异表达分析流水线，请改用 alterlab-scanpy；若需 .h5ad 数据结构 I/O 与层操作，请改用 alterlab-anndata。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-stable-baselines3

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 Stable-Baselines3 训练单智能体强化学习 Agent——PPO、SAC、DQN、TD3、DDPG 和 A2C，提供类似 scikit-learn 的 API。适用于标准单智能体 RL 实验、快速原型开发、在 Gymnasium 环境上使用文档完善的算法实现，或添加回调与评估。若需高吞吐并行训练、多智能体系统或自定义向量化环境，请改用 alterlab-pufferlib。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-string-db

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

通过 STRING API 查询蛋白质-蛋白质相互作用（5900 万种蛋白质、12,500+ 个生物中的 200 亿+ 相互作用），构建相互作用网络、发现功能伙伴，并对蛋白质列表运行 GO/KEGG/Pfam 富集分析。适用于构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、从种子蛋白扩展到功能伙伴，或运行基于 PPI 的系统生物学富集分析；若需经过整理的代谢通路图与反应，请改用 alterlab-kegg；若需蛋白质序列、注释或登录号 ID 映射，请改用 alterlab-uniprot。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-timesfm

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 Google 的 TimesFM 基础模型进行零样本时间序列预测——TimesFM 2.5（200M，Apache-2.0 权重；ForecastConfig API、XReg 协变量）和 TimesFM 3.0（约 330M，多变量，支持原生过去/未来协变量；非商业权重）——可从 CSV/DataFrame/数组输入生成点预测和分位数预测区间，并配有用于检查 RAM/GPU 的预检系统检查器。适用于在不训练自定义模型的情况下预测单变量或多变量序列（销售、传感器、能源、生命体征、天气）、批量预测多条序列，或基于预测区间标记异常。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-torchdrug

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 TorchDrug 为分子和蛋白质构建 PyTorch 原生的图神经网络，提供自定义 GNN 架构、任务/数据集抽象、分子生成、逆合成规划以及知识图谱推理。适用于项目明确需要 TorchDrug 的数据集与任务时——GearNet 蛋白质结构模型、中心识别/synthon-completion 逆合成，或 Hetionet 知识图谱基线。TorchDrug 自 0.2.1（2023 年 7 月）以来再无发布，且需要 Python < 3.11，因此新的自定义 GNN 工作请改用 alterlab-torch-geometric，现成的特征化器、MoleculeNet 基准和预训练模型请改用 alterlab-deepchem。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-transformers

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 Hugging Face Transformers v5（仅 PyTorch）加载、运行和微调预训练模型——用 pipeline() 推理进行对话模型文本生成、文本分类、NER、零样本、语音识别、图像分类、目标检测以及图文到文本的 VLM；用 AutoModel/AutoTokenizer 加载，支持 dtype、device_map 和 bitsandbytes 量化；用 generate() 控制解码；用 Trainer 微调并可选用 PEFT/LoRA。适用于使用 Hugging Face Hub 检查点进行推理、在自定义标注数据集上微调 BERT/ModernBERT/Qwen 风格模型、控制生成（采样、束搜索、流式、对话模板），或将 v4 代码（torch_dtype、已移除的摘要/翻译/QA pipeline、TF/Flax）迁移到 v5。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-umap

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

使用 UMAP 进行非线性降维——用于 2D/3D 可视化的快速流形学习、聚类预处理（如 HDBSCAN）以及有监督或参数化 UMAP。适用于将高维数据投影到低维以进行可视化、生成嵌入，或作为聚类前的预处理步骤。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-uniprot

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

提供对 UniProt（Swiss-Prot/TrEMBL）的直接 REST API 访问，用于蛋白质序列搜索、FASTA 获取、功能注释（GO 术语、结构域）以及跨数据库 ID 映射。适用于查询蛋白质条目、获取蛋白质 FASTA 序列，或通过原始 HTTP/REST 在数据库之间映射登录号；对于实验性 3D 结构优先使用 alterlab-pdb，对于 AI 预测的 3D 结构优先使用 alterlab-alphafold-db，对于蛋白质-蛋白质相互作用网络优先使用 alterlab-string-db，而对于跨多个数据库的 Python 工作流则优先使用 alterlab-bioservices。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-usfiscaldata

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

查询美国财政部 Fiscal Data API，覆盖 50 多个数据集和约 180 个数据表（无需 API 密钥），获取关于国家债务、政府支出、收入、利率、汇率和储蓄债券的联邦财政数据。适用于处理美国联邦财政数据、国家债务追踪（Debt to the Penny）、Daily Treasury Statements、Monthly Treasury Statements、国债拍卖、国债利率、外汇汇率、储蓄债券或任何美国政府财政统计数据。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-uspto

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

通过 Open Data Portal（ODP）API 访问 USPTO 专利和商标数据——Patent File Wrapper 搜索、审查历史（PEDS 的后继）、连续案、转让、审查意见通知书、PTAB 决定——并通过 TSDR 获取商标状态。适用于搜索专利或商标、进行现有技术检索、获取专利审查或转让记录，或进行知识产权（IP）分析。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

alterlab-zinc-db

alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

访问包含 2.3 亿多种市售（可购买）化合物的 ZINC 数据库，可按 ZINC ID 或 SMILES 搜索、运行相似性搜索，并下载可用于 3D 的结构。适用于为虚拟筛选组装化合物库、寻找可购买的类似物，或为药物发现获取可用于对接的 3D 结构。属于 AlterLab Academic Skills 套件。

A

analytics-tracking

kimny1143 / claude-code-template

当用户希望设置、改进或审查分析跟踪与衡量时使用。用户提到“设置跟踪”“GA4”“Google Analytics”“转化跟踪”“事件跟踪”“UTM 参数”“标签管理器”“GTM”“分析实施”或“跟踪计划”时也使用。A/B 测试衡量请参阅 ab-test-setup。

设置、审计和调试分析跟踪实现——GA4、Google Tag Manager、事件分类、转化跟踪和数据质量。适用于从零构建跟踪计划、审计现有分析以查找缺口或错误、调试缺失事件，或设置 GTM。触发关键词：GA4 setup、Google Tag Manager、GTM、event tracking、analytics implementation、conversion tracking、tracking plan、event taxonomy、custom dimensions、UTM tracking、analytics audit、missing events、tracking broken。不适用于分析营销活动数据——请使用 campaign-analytics。不适用于 BI 仪表盘——请使用 product-analytics 进行产品内事件分析。

A

aso-analysis

appfollow / appfollow-ai-toolkit

分析应用或应用集合的 ASO 表现，包括跟踪关键词排名及（由 gate-iv 控制的）趋势、类别排名趋势、结合竞争对手情况的关键词机会、交互式添加关键词流程（唯一写入路径），以及诚实的元数据建议。生成结构化的 findings.json 和自包含 HTML 报告。用户提到“ASO 报告”“关键词排名”“关键词机会”“我们如何在 <关键词> 上获得排名”“建议添加关键词”时触发。

A

autodiscovery

allenai / asta-plugins

创建、配置并监控 AutoDiscovery 运行——可通过托管服务（`asta autodiscovery`）或本地命令行（`asta-autodiscovery`）。当用户询问其运行、实验、发现，想查看状态，或想启动新的发现运行时使用。

A

azure-data-tables-java

sickn33 / agentic-awesome-skills

使用 Azure Tables SDK for Java 构建表存储应用。同时适用于 Azure Table Storage 和 Cosmos DB Table API。

B

bingx-trade-review

bingx-api / api-ai-skills

适用于用户索取 BingX 永续合约交易回顾、绩效分析、盈亏摘要、胜率、交易日志、近期交易表现、交易标签、复盘反思或每周盈亏时。它从 bingx-swap-account 获取交易历史，计算统计数据，生成本地图表，并支持自定义标签和复盘笔记。

C

campaign-roi-calculator

archive-dot-com / creator-marketing-skills

根据原始表现数据计算达人活动 ROI，并构建面向管理层的叙述式总结。在计算创作者活动 ROI、为管理层构建活动表现报告、将原始达人指标转化为高管摘要、为创作者项目计算 CPM、CPE、ROAS 和 EMV、为利益相关方会议总结活动支出与收入、向 CMO 或 VP 证明达人营销 ROI、创建含财务指标的活动结案报告，或将达人渠道效率与付费社交进行对比时，应使用此技能。活动上线前设定 KPI 目标见 performance-benchmark-setter。追踪创作者发布合规性见 creator-posting-compliance-tracker。含定性分析的完整结案报告见 post-campaign-creator-scorecard。构建用于归因的 UTM 链接见 utm-parameter-builder。

C

causal-inference-mixtape

brycewang-stanford / auto-empirical-research-skills

当用户要求「实现 DiD 回归」「编写因果推断 pipeline」「搭建事件研究」「实现工具变量」「运行断点回归设计」「构建合成控制模型」「实现倾向得分匹配」「编写平行趋势检验」「实现 Bacon 分解」，或需要 Python、R 或 Stata 中因果推断方法的代码模板时，应使用此 skill。基于 Scott Cunningham 的 Causal Inference: The Mixtape。

C

cdata-cli-python

cdatasoftware / cli-skills

在编写通过 CData 驱动连接数据源的 Python 应用代码时使用——前提是已用 cdata-cli 发现技能验证过连接与 SQL。内容涵盖：将语言映射到 CData Python Connector 版本、从 CData 的 Python 仓库下载连接器 wheel、激活其许可证，以及通过 DB-API 2.0（cdata.<source>.connect）连接。这是 cdata-cli 在 Python 构建阶段的配套技能；只要目标应用语言是 Python（Salesforce、Snowflake、Jira、Gmail 等）就调用它。

C

chart-implementation

motormetrics / motormetrics

使用 Recharts 为车辆注册和 COE 数据可视化创建交互式图表。适用于添加新图表类型、修复图表缺陷或实现数据可视化。

C

cloud-azure-sql

partme-ai / full-stack-skills

为 Azure SQL Database 提供全面指导，包括数据库创建、配置、安全性以及 Azure SQL 管理。当用户询问 Azure SQL、需要创建 Azure SQL 数据库、配置 Azure SQL 或管理 Azure 数据库服务时使用。

C

cloud-huawei-rds

partme-ai / full-stack-skills

为华为云 RDS 提供全面指导，涵盖数据库创建、配置、备份以及 RDS 管理。当用户询问华为云 RDS、需要创建 RDS 数据库、配置 RDS 或管理华为云数据库服务时使用。

C

community-kpi-dashboard

gtmagents / gtm-agents

衡量社区参与度、健康度和业务影响的测量系统

C

create-knowledgebase

bolna-ai / skills

从 PDF 文件或 URL 创建、列出、查看和删除 Bolna 知识库,包括多语言检索设置、分块、重叠、相似度 top k、处理状态、rag_id 和 vector_id 的用法。当语音 Agent 需要对 FAQ、政策、产品文档或网页进行 RAG 时使用。

C

creative-analyzer

dengineproblem / agents-monorepo

Facebook Ads 创意分析专家。用于评估创意效果、Risk Score、A/B 测试以及改进建议。

C

crypto-price

evgyur / crypto-price

通过 Hyperliquid/CoinGecko 生成加密货币代币价格和 K 线图的 Router 技能。

D

data-profiler

majesticlabs-dev / majestic-marketplace

为 DataFrame 生成数据剖析，包含列统计、相关性和缺失模式。用于 EDA 和数据探索。

D

database-architecture

troykelly / claude-skills

在设计 schema、编写迁移、创建索引或做出数据库架构决策时强制使用——落实 PostgreSQL 18 最佳实践，包括 AIO、UUIDv7、时态约束和现代索引策略

D

dataset-curation

fcakyon / phd-skills

当用户想分析数据集偏差、创建分层样本、评估公平性或规划数据集采集时使用。触发词如 \"dataset bias\"、\"stratified sample\"、\"class imbalance\"、\"data distribution\"、\"fairness analysis\"、\"ethical review\"。

D

dby-api

zizhanovo / doubaoya-community

都爆鸭（doubaoya/本鸭）新媒体取数包：DOUBAOYA_API_KEY 取在架数据，做联网事实核查。只给数据：写正文归 dby-write、查违禁词归 dby-banned-words、排版存草稿归 dby-publish，不确定问 dby。要成品图（出图/改图/配图/主视觉）归 dby-image，本包只给封面与标题的**参考数据**。触发词：小红书：搜索/爬取/作品/创作/选题/标题/封面/排行/榜单/热榜/日榜/周榜/周排行/TOP/热门笔记/爆款笔记/笔记查询、公众号：取数/爬虫/标题/封面/排行/榜单/爆文/黑马/对标、抖音：搜索/取数/评论/实时搜索/综合搜索、视频号：AI/日报/爆款/选题、爆款：文章/标题/封面/结构/仿写/复盘/排行/选题/笔记发现、选题：拆解/灵感/素材/角度/信号、封面：灵感/参考/套路/设计/选题、标题：灵感/优化/套路/生成、账号画像/账号体检/账号健康度/账号发文列表、对标：分析/作品/推荐/矩阵/账号/后再写、竞品：账号/诊断/跟踪/发文复盘、出海：选题/爆款/日报/流量风口、笔记：对标/拆解/生成/选题、内容：创作/灵感/出海、跨平台：选题/分析/热搜、热点：扫描/榜、今日热点/综合热点/追热点/蹭热点/借势选题/找选题/中线选题/短视频选题/全网热搜/热搜关键词/全网热榜/聚合热榜/热榜 TOP10/每日榜/今日爆款/一周爆款/近期爆款/全平台爆款/低粉爆款/素人爆款/搜抖音爆款、低粉高赞/黑马笔记/黑马账号/头部账号/热门账号/相似账号/标杆账号/小号打法/冷启动对标/起号参考/公众号诊断/批量诊断/被限流/阅读量掉了/周度趋势/近 30 天作品/最新发布/最多点赞/持续走高/增长榜/阅读增长/增长率排行/流量风向/热度指数/追流量/追更/话题研究/看赛道热门内容、高点击标题/起标题、查出处/引用来源/联网搜索/联网查证/豆包搜索/社媒舆情/舆情监测/用户需求/评论分析/评论风向/看评论/扒评论区、解析链接/链接解析/作品详情/扒文章/扒抖音作品/照着写小红书/找对标笔记/热门文章/批量爬公众号/盯公众号/订阅公众号/某公众号发了什么、AI 视频号/小红书抖音公众号/文旅/短剧/赛道日报/每天在推什么/实时取数

D

degenerate-input-filtering

jaechang-hits / sciagent-skills

在统计检验前过滤退化、无信息量的输入:单序列比对、空文件、常量特征、零方差输入、全为 NaN 的列。NaN 感知的相关性见 nan-safe-correlation;检验指导见 statistical-analysis。

D

develop-contribution

vincenzoimp / academic-research-skills

在创建新的贡献（分析、实验、数据集、软件、复现）时使用，或把草稿文件夹规范化，使其连同 LaTeX 报告符合徽章要求。

D

django-orm-query-optimization

lvtd-llc / skills

通过修复 N+1 查询、重复的关联对象查询、过度获取、序列化器/模板中的查询循环，以及不当的 select_related、prefetch_related、only 或 defer 用法，优化 Django ORM 查询加载。当 Django 页面、API、admin 视图、模板、序列化器或 queryset 发出过多查询，或加载的模型数据超出所需时适用。

D

drugbank-database-access

jaechang-hits / sciagent-skills

解析本地 DrugBank XML,获取药物信息、相互作用、靶点和属性。按 ID/名称/CAS 搜索,提取带严重程度的 DDI,映射靶点/酶/转运体,计算 SMILES 相似度。主要通过本地 XML;REST API 有速率限制(开发版每月 3k)。实时生物活性请使用 chembl-database-bioactivity;化合物属性请使用 pubchem-compound-search。

D

duckdb

tondevrel / scientific-agent-skills

一种进程内分析型 SQL 数据库管理系统。专为快速分析查询（OLAP）而设计。与 Python 数据生态（Pandas、NumPy、Arrow、Polars）高度互操作。无需摄入步骤即可直接查询文件（CSV、Parquet、JSON）。用于对 Pandas/Polars 数据执行复杂 SQL 查询、直接查询大型 Parquet/CSV 文件、连接不同来源的数据、分析管道、超出 Excel 处理能力的本地数据集、为机器学习进行中间数据存储和特征工程。

F

feedback-analysis

appfollow / appfollow-ai-toolkit

分析某个时间窗口内的应用或合集反馈：提供带上个窗口变化值的 KPI、评分/数量/情绪趋势、异常提示及按排名排列的主要错误和功能请求；随后生成结构化的 findings.json 和独立 HTML 报告。只读（绝不写入）。在用户提出“feedback report”“how are our reviews”“what are users complaining about”“review trends for <app>”“what are our testers saying”（Google Play 测试反馈）时触发。

模型微调服务 | Model Fine-tuning Service。LLM LoRA/QLoRA 微调 | LLM LoRA/QLoRA fine-tuning。7B/13B 模型微调 | 7B/13B model fine-tuning。Stable Diffusion LoRA 训练 | Stable Diffusion LoRA training。利用 20GB 显存优势 | Leveraging 20GB VRAM advantage。触发词：微调、fine-tune、LoRA、训练模型。

F

frame-data-chart-nyt

nexu-io / html-video

NYT 编辑部排版、错落显现动画，以及编辑级的图表（折线图、柱状图或区间带）。

G

gempy

steadfastasart / geoscience-skills

使用隐式方法进行三维构造地质建模。根据地表点与产状创建含断层、褶皱和不整合的地质模型。当 Agent 需要：(1) 根据地表接触点与产状构建三维地质模型，(2) 对断层、不整合或侵入体建模，(3) 计算并可视化地下地质，(4) 将模型导出为 VTK 或 numpy 数组，(5) 生成重力正演模型，(6) 创建剖面或三维可视化时使用。

G

geo-visualizer

dkyazzentwatwa / chatgpt-skills

创建带标记、热力图、路线和分级统计图层的交互式地图。在可视化地理数据、标注位置或制作基于地图的报告时使用。

G

grafana-billing

nodnarbnitram / claude-code-extensions

从 Grafana 查询 Prometheus 和 Loki 的计费指标。在讨论可观测性成本、活跃序列、摄取速率、存储用量或基数分析时使用。

G

grove-account-deletion

autumnsgrove / lattice

通过 wrangler D1 命令删除 Grove 租户账户。当用户想移除测试账户、在演示后清理，或彻底删除某用户的数据时使用。处理 D1 CASCADE 清理、R2 媒体清除和 Heartwood 会话失效。

H

helix-admin-mcp

helixdb / skills

通过托管的 Admin MCP 服务检查客户数据库密钥，并执行明确请求、需经确认把关的 Helix Cloud 租户或数据库密钥变更。仅用于创建/删除租户以及创建/吊销数据库密钥操作。切勿暴露运营密钥、绕过持久确认，或扩展到被排除的 Cloud 生命周期范围。

H

histolab-wsi-processing

jaechang-hits / sciagent-skills

面向数字病理的 WSI 处理。组织检测、瓦片提取(随机、网格、基于评分)、针对 H&E/IHC 的过滤流水线。适用于数据集准备、基于瓦片的深度学习、切片 QC。多重成像请使用 pathml。

H

homer-motif-analysis

jaechang-hits / sciagent-skills

通过 HOMER 对 ChIP-seq/ATAC-seq 峰进行从头和已知 TF 基序富集分析。findMotifsGenome.pl 找出相对背景过度呈现的模式;annotatePeaks.pl 赋予上下文(TSS 距离、基因、重复序列)。在 MACS3 之后使用,以识别富集的 TF、用最近基因注释峰,并通过目标基序验证 ChIP-seq。

H

hypogenic-hypothesis-generation

jaechang-hits / sciagent-skills

在表格数据上由大模型驱动的假设生成/检验。三种方法:HypoGeniC(数据驱动)、HypoRefine(文献+数据)、Union。迭代精炼、Redis 缓存、多假设推理。手动方式:hypothesis-generation;构思:scientific-brainstorming。