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收录 100,928 个为 Agent 打包的专项能力与操作指引,复制一行命令即可安装。
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用于在 Polars DataFrame 上进行基因组区间操作和生物信息学文件 I/O 的 Python 库 polars-bio,基于 Arrow 和 DataFusion。支持重叠、最近邻、合并、聚类、覆盖度、补集、相减、count_overlaps、逐碱基 pileup 深度,以及读取、扫描和写入 BED、VCF、BAM、CRAM、SAM、GFF/GTF、FASTA、FASTQ,还支持对这些文件执行 SQL 查询。用于在 Polars 中求基因组区间交集或合并;读取或流式处理大型 BED、VCF 或 BAM 文件(包括来自 S3、GCS 或 Azure 的文件);计算 BAM 或 CRAM 的读段深度;对基因组文件运行 SQL;或将 bioframe 代码迁移到更快的替代方案。不适用于不使用 Polars 或 DataFusion 的纯 pandas 工作流。
通过 PRIDE Archive v3 REST API 搜索蛋白质组学数据集:按关键词 + 分面过滤器(物种、仪器、疾病、软件)发现项目,获取项目元数据,列出并下载 RAW/PEAK/RESULT/FASTA 文件(含 FTP/Aspera URL),查找哪些项目提及某个 UniProt 登录号,并找到相似项目。PRIDE v3 不再提供肽段/PSM 级鉴定端点——需要谱图级数据请下载项目的 RESULT 文件。蛋白质序列请用 uniprot-protein-database;结构域架构请用 interpro-database。
使用 PyHealth 按 Dataset → Task → Model → Trainer → Metrics 模式构建临床深度学习管道。涵盖加载 MIMIC-III/IV、eICU、OMOP、SleepEDF、ChestXray14 和 EHRShot 数据,定义预测任务(死亡率、再入院、住院时长、药物推荐、睡眠分期、ICD 编码、EEG 事件),使用 Transformer、RETAIN、GAMENet、SafeDrug 和 StageNet 等模型,通过 Trainer 训练,以及 ICD/ATC/NDC/RxNorm 代码查询和交叉映射。适用于基于 EHR 数据构建临床预测模型、处理 MIMIC 或 eICU 数据集、根据信号推荐药物或进行睡眠分期,以及映射 ICD、ATC、NDC 或 RxNorm 医疗代码。不适用于通用表格数据上的 PyTorch。
内核逆向(跨平台):Windows 驱动(.sys/IRP/SSDT)、Linux 内核模块(.ko/ET_REL/LKM/rootkit)、macOS KEXT 与 System Extension/DriverKit、Android GKI/vendor module、seL4(capability 系统)、Fuchsia/Zircon(handle 模型 + DFv2 用户态驱动框架)、FreeBSD(linker sets/SYSINIT/KLD)、illumos/Solaris(DDI/DKI、dev_ops/cb_ops)、OpenBSD(KARL/autoconf/pledge)、NetBSD(模块按需自动加载)、Genode(组件树/session/quota)、MINIX 3(RS 自愈/grants/live update)、Plan 9(命名空间/9P)、HelenOS(fibril/DDF)、Redox(scheme)、Haiku(device_node/按需发现)、z/OS(TCB·SRB/cross-memory)、IBM i(单一存储层)、OpenVMS(AST)、Unikraft·MirageOS(unikernel)、HIC(同特权级 MMU 隔离的驱动模型 / capability / 物理沙箱 / 自描述模块 / 入口页 IPC)。触发词:内核、驱动、.sys、.ko、LKM、kext、dext、rootkit、内核模块、IRP、GKI、内核扩展、seL4、capability、CSpace、CNode、capDL、CAmkES、MCS、Fuchsia、Zircon、handle、DFv2、driver host、FIDL、FreeBSD、KLD、SYSINIT、linker set、illumos、Solaris、DDI、dev_ops、cb_ops、OpenBSD、KARL、autoconf、pledge、unveil、NetBSD、kmod、GENODE、session、quota、MINIX、RS、grant、9P、Plan 9、namespace、HelenOS、fibril、DDF、Redox、scheme、Haiku、device_node、z/OS、TCB、SRB、cross-memory、IBM i、single-level storage、OpenVMS、AST、$QIO、unikernel、Unikraft、MirageOS。English triggers: kernel module, driver reversing, LKM, kext, rootkit, GKI, seL4, capability system, capDL, Fuchsia, Zircon, handle, driver framework, FIDL, FreeBSD, KLD, SYSINIT, linker set, illumos, Solaris, DDI, dev_ops, cb_ops, OpenBSD, KARL, autoconf, pledge, NetBSD, kmod, Genode, session, quota, MINIX, reincarnation server, grant, 9P, Plan 9, namespace, HelenOS, fibril, DDF, Redox, scheme, Haiku, device node, z/OS, TCB, SRB, cross-memory, IBM i, single-level storage, OpenVMS, AST, QIO, unikernel, Unikraft, MirageOS。
确保仓库的 README 面向决定是否以及如何使用它的人,AGENTS.md(或通过它读取的 CLAUDE.md)面向在仓库内工作的 Agent,清单文件则面向首先读取它们的宿主(package.json、插件和市场文件、agents/openai.yaml)。围绕仓库的唯一名称,使用随附脚本审查这些文件,然后将各行移至其读者需要的位置,并修正不一致的清单。适用于编写、重写或审查 README 或 AGENTS.md、Agent 专用命令出现在 README 或营销文案出现在 Agent 指南中、决定某个章节属于哪个文件,或重命名之后。不适用于合同、账本、变更日志或发行说明。
防止学术写作中的引用幻觉。在以下情况调用:寻找论文以支持特定主张;验证/检查/审查现有引用或 DOI;确认论文是否真的说了用户声称的内容("is that what the paper says?"、"did they actually show X?");通过描述论文来添加引用("add a citation for the paper where X");运行投稿前参考文献排查。不要调用:按 APA/IEEE 格式排版参考文献、一般主题解释、引用格式问题或散文编辑。自动选择 Quick Screen(每篇论文数秒)或 Full Audit(源深度主张核查)。
一个开放协议,规定了 AI 应用如何以统一方式连接外部工具与数据源。客户端负责与模型对话,MCP 服务负责提供工具、资源和提示模板,两者通过标准消息通信,同一个服务可以被不同客户端复用。
