Skills
エージェント向けにパッケージ化された専門スキルと手順を 97,222 件掲載。コマンド 1 行でインストールできます。
データ・データベース
2.4 億件以上の AI 予測タンパク質構造の AlphaFold DB(v6、事前計算済みのホモ二量体/ヘテロ二量体複合体を含む)にアクセス——UniProt accession でモデルを取得し、PDB/mmCIF ファイルをダウンロードし、予測信頼度指標(pLDDT、PAE)を分析する。UniProt ID に計算予測された 3D 構造が必要な場合、または実験構造が存在しない場合に使用し、相同性モデリング、タンパク質工学、構造ベースの創薬に適する。実験的に決定された構造(X-ray、cryo-EM、NMR)には alterlab-pdb を、新しい配列や複合体を自分でフォールディングするには alterlab-alphafold を、タンパク質配列、アノテーション、accession ID のマッピングには alterlab-uniprot を優先する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
キー不要の REST API を通じて cBioPortal を照会し、TCGA、GENIE、MSK-IMPACT および数百の研究にわたるがんゲノム情報——体細胞変異、コピー数変化 (GISTIC)、mRNA/タンパク質発現、構造変異、患者レベルの臨床/生存データ——を取得する。ある腫瘍種において遺伝子がどのくらいの頻度で変異/増幅/欠失するかを尋ねられたとき、がん種をまたいでがん遺伝子やがん抑制遺伝子をプロファイリングするとき(pan-cancer 変異頻度)、OS/臨床アウトカムと結合した患者レベルの変異を取得するとき、またはコホートゲノム情報からがん標的を検証するときに使用する。生殖細胞系列変異の病原性には alterlab-clinvar、変異シグネチャー (SBS) の分解には alterlab-cosmic、CRISPR/RNAi 遺伝子依存性には alterlab-depmap、集約された標的-疾患エビデンスには alterlab-opentargets を使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
deepTools のコマンドラインでディープシーケンシングのカバレッジを処理・可視化する——BAM を bigWig に変換 (bamCoverage)、log2 比トラックを構築 (bamCompare)、QC を実行(multiBamSummary 相関、PCA、plotFingerprint)、ATAC-seq の Tn5 シフトを適用 (alignmentSieve --ATACshift)、TSS/ピークのヒートマップとプロファイルを作成 (computeMatrix、plotHeatmap、plotProfile)。カバレッジトラック、シグナルのヒートマップ/プロファイル、正規化 (RPGC/CPM/RPKM)、ChIP-seq、ATAC-seq、MNase-seq、RNA-seq の有効ゲノムサイズの参照に使用する。リード単位/CIGAR/MAPQ の BAM レコードアクセスには使用しない——それは pysam。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
NCBI GEO(Gene Expression Omnibus)にアクセスし、遺伝子発現および機能ゲノミクスのデータを扱う。GSE、GSM、GPL、GDS のアクセッションでマイクロアレイや RNA-seq データセットを検索・ダウンロードし、SOFT、MINiML、series matrix ファイルを取得する。公開の発現データセットを探す場合、処理済み発現行列を取得する場合、研究の補足ファイルをダウンロードする場合、差異発現解析のために研究単位のトランスクリプトームデータを入手する場合に使用する。SRA/ENA のランアクセッションで生の FASTQ シーケンスリードを取得する場合は alterlab-ena を、参照組織発現のベースライン(ヒト組織ごとの中位 TPM)には alterlab-gtex を、がんコホートの体細胞変異とコピー数には alterlab-cbioportal を使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
gget のコマンドラインまたは Python から 20 以上のバイオインフォマティクスデータベースへ高速なワンライナー照会を実行する——遺伝子情報 (Ensembl)、BLAST、AlphaFold 構造、Enrichr エンリッチメントなど。遺伝子、配列、構造、パスウェイの素早い対話的な検索に使用する——バッチ処理や高度な BLAST には biopython、複数データベースの Python ワークフローには bioservices を使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
NHGRI-EBI GWAS Catalog REST API v2 を照会してキュレーションされた SNP-形質関連を取得し、rs ID、疾患/形質(EFO/MONDO)、遺伝子、研究(GCST)で変異を検索して p 値、効果量、祖先情報を取得するとともに、FTP サイト上で整備済みの完全な要約統計を特定する。ゲノムワイド関連研究のヒットの調査、SNP や rsID の形質へのマッピング、ポリジェニックリスクスコアやファインマッピングのための GWAS の選定、遺伝疫学の検索に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
生の配列から系統樹をエンドツーエンドで構築する——MAFFT による多重配列アラインメント、任意の TrimAl によるトリミング、モデル選択とブートストラップを伴う IQ-TREE 3 の最尤推定、大規模データセット向けの FastTree、その後 ETE3 または FigTree で可視化する。進化解析、微生物ゲノム学、ウイルス系統動態、タンパク質ファミリー研究、分子時計による年代推定のために配列 (FASTA) から樹を再構築するときに使用する。既存の Newick 樹の操作/比較(枝刈り、ルート付け、Robinson-Foulds、重複/種分化イベント)には alterlab-etetoolkit、単純な配列のパース/翻訳には alterlab-biopython を使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
クリーンで読みやすいモダンなウェブページの本文コンテンツを取得。WeChat 公式アカウント記事の取得と末尾ノイズのクリーニングに対応し、無駄な情報と token 消費を削減する。ニュース、ブログ、お知らせ、および通常の fetch が不安定だったり、アンチスクレイピングや動的レンダリングの干渉がある多くのページに適する。Clean readable web fetch for modern pages, with WeChat cleanup, markdown output, batch fetch, selector overrides, and support for many hard-to-fetch pages.
Confluent Cloud 上で動作する Flink SQL を書き、デバッグする。CC と Apache Flink(OSS)の方言の境界を厳守する。作業ディレクトリが Confluent Cloud Flink ワークスペースである場合、Flink SQL ステートメントを CC コンピュートプールで実行する前に確認する必要がある場合、またはユーザーが CC Flink、Confluent Cloud Flink SQL、`confluent flink` CLI、CFU コンピュートプール、`CREATE CONNECTION` に言及する場合、あるいはランタイムが Confluent Cloud である Flink SQL の確認やデバッグを求める場合に使用する。Flink SQL の質問がなされ、Apache Flink OSS のランタイムであることが何も示されない場合にもトリガーする。以下ではトリガーしない: Java での Flink UDF の構築・デプロイ(UDF/UDTF/PTF — flink-udf を使用); データベースから Flink を経て Tableflow/Iceberg/Delta Lake に至る完全な CDC パイプライン(confluent-cloud-cdc-tableflow を使用); Kafka Streams のトポロジ作業(kafka-streams-programming を使用); または Flink SQL が Confluent Cloud ではなく Apache Flink OSS で動作することが確認されている場合。
Datadog ダッシュボードを構築する際にモデルが持ちがちな誤ったデフォルトを正す。2026 年 7 月に Datadog のドキュメントで検証済み。Datadog ダッシュボードの作成、編集、レビュー時に使用する——ウィジェットの選択、metric/log/span クエリの記述、ウィジェット JSON の生成。もっともらしい数値を描画しつつ誤っているクエリを扱う——`.as_count()` は graph editor では自動的に付与されるが API 経由では決して付与されないため、プログラムによるカウントは暗黙に平均化される。`p95` は distribution メトリクスでのみ解決され、それを平均するのは平均の平均になる。比率は両側に `.as_count()` が必要で、そうでなければ補間された平均を割ることになる。また、存在するメトリクスに基づかせること(架空の名前を使わないこと)、UI の名前と異なる wire type 文字列(Pie Chart は `sunburst`、Table は `query_table`)、Datadog 自身のレイアウト標準も扱う。Datadog MCP サーバーが接続されていることを前提とする。Terraform や素の Dashboard API の管理、monitor と SLO の作成、Datadog 以外の可観測性ツールには使用しない。
マネージドプラットフォーム適合性(M21)— プロジェクトをホスティングプラットフォーム(Supabase、Neon、PlanetScale、Turso、Cloudflare D1、CockroachDB、Yugabyte、DynamoDB、RDS/Aurora)の実情と照らし合わせて確認する。エンジンバージョンの新しさ(EOL 日付を捏造しない)、誠実な価格 / ベンダーロックインのトレードオフ、プラットフォームごとの機能サポート — 最も重要なのは外部キーサポート(PlanetScale Vitess は歴史的に FK を制限している。D1/SQLite、サーバーレスドライバー、接続数制限)。Design & Integrity と Performance & Scale の両スコアに反映される。
専用エンジンの適合性(M20)— ベクトル、時系列/OLAP、グラフ、検索ストアがその用途に合わせて正しく構成されているかを確認する。M20a ベクトル(次元が埋め込みモデルと一致し、距離指標がモデルの学習方法と一致し、HNSW/IVFFlat パラメータが存在する)、M20b 時系列/OLAP(ハイパーテーブル/パーティションの適合性、継続的集約、圧縮)、M20c グラフ(エッジモデリング、スーパーノードリスク、インデックスに支えられたルックアップ)、M20d 検索(アナライザー/マッピング、FTS 設定)。サブモジュールごとに Design & Integrity と Performance & Scale のスコアに反映される。
Deneb ビジュアルの作成、Vega/Vega-Lite スペックの記述、PBIR レポートにおける Deneb のベストプラクティス。ユーザーがどのような文脈で「Deneb」に言及した場合でも、または Power BI の Vega/Vega-Lite スペック、Deneb のクロスフィルタリング、Deneb のインタラクティブ性、pbiColor テーマ統合、Deneb のフィールド名エスケープ、Deneb の描画問題について尋ねた場合に自動的に呼び出す。
伝統的な Stata エコシステムにおける古典的なエンドツーエンド実証分析ワークフロー——ネイティブ Stata + reghdfe + ivreg2 + csdid + did_imputation + eventstudyinteract + sdid + rdrobust + rddensity + synth + synth_runner + psmatch2 + teffects + ebalance + coefplot + esttab + asdoc + binscatter。**デフォルトで経済学実証論文スタイル**(AER / QJE / AEJ)——各実行で出版可能な出力セットを生成し、多列回帰表(M1→M6 の段階的な統制変数/固定効果)を中心に、表 1(記述統計)、メカニズム/異質性/頑健性の表、イベントスタディ図・係数図・トレンド図を付す。応用経済学者が毎論文で実行する完全な 8 ステップの Stata パイプラインを網羅——(1) データのインポートとクリーニング(use/import、destring、misstable、duplicates、merge assert)、(2) 変数構築(gen/egen/winsor2/xtile/xtset と L./F./D.)、(3) 記述統計と表 1(tabstat/balancetable/asdoc)、(4) 古典的な診断検定(sktest/swilk/hettest/imtest/xtserial/xttest3/vif/dfuller/kpss/hausman/estat overid)、(5) ベースライン・モデリング(reg/xtreg/reghdfe/ivreg2/ivregress/csdid/did_imputation/eventstudyinteract/sdid/rdrobust/synth/psmatch2/teffects/heckman/qreg/ppmlhdfe)、(6) 頑健性チェック一式(bacondecomp/honestdid/rwolf/ritest/wildbootstrap/oster)、(7) 追加分析(サブグループ/三重差分/交互作用項/medsem/marginsplot/グループ別 binscatter)、(8) 出版可能な表と図(esttab/outreg2/estout/coefplot/marginsplot/rdplot/twoway の組み合わせ)。**同じ 8 ステップの骨組みを共有する 2 つの並行ドメインモードも網羅**——**モード A——疫学/公衆衛生**(対象試験エミュレーション、`teffects ipw` / `teffects ipwra` / `teffects aipw` / `eltmle` による IPTW + g-formula + TMLE の二重頑健トリプレット、`mrrobust`(IVW / Egger / 加重中央値)と `mregger` / `mrpresso` によるメンデルランダム化、`sts` / `stcox` / `streg` / `strmst2` による KM / Cox / AFT / RMST 生存分析、`evalue`(Linden-Mathur)による E 値感度分析、主層化——STROBE / TRIPOD 報告)、および **モード B——ML 因果推論**(`ddml` / `pdslasso` による DML、`crforest` と `ddml interactive` による S/T/X/R/DR メタ学習器、`crforest` / `cforest` による因果フォレスト、`bart` / `bartCause` 系の外部コマンドによる BART/BCF、`crforest` による CATE 分布 + ポリシーツリー、オフポリシー評価、共形因果外部コマンド、公平性監査、`pcalg` / 外部 Python 呼び出しによる DAG 学習)。ユーザーが完全な Stata 実証分析を求めたり、再現可能な .do ファイルのパイプラインを必要としたり、Python StatsPAI / Full-empirical-analysis-skill に対応する Stata 版を必要としたり、特定の Stata ステップを単独で指定したりする場合に使用("run reghdfe with two-way clustering"、"csdid event study"、"winsor2 at 1%"、"esttab to LaTeX"、"coefplot with CI"、"ivreg2 weak-IV test"、"synth_runner placebos"、"teffects psmatch balance check")。モード A のトリガー:"target trial emulation Stata"、"teffects ipw aipw"、"eltmle"、"mrrobust"、"mregger weighted median"、"stcox AFT survival"、"strmst2"、"evalue Stata"、"STROBE Stata"、"公共健康 Stata"、"流行病学 Stata"。モード B のトリガー:"ddml Stata"、"pdslasso"、"crforest causal forest Stata"、"policy tree Stata"、"因果机器学习 Stata"。
ユーザーが大屏(大屏)の作成/設計、全画面データ可視化を依頼したとき、または "创建大屏"、"生成大屏"、"新建大屏"、"设计大屏"、"做一个大屏"、"BI大屏"、"数据大屏"、"可视化大屏"、"监控大屏"、"create big screen"、"design big screen"、"BI visualization big screen" と言ったときに使用する。"做一个销售数据大屏" のような大屏の要件を説明したときや、"展厅展示"、"监控室大屏" のような全画面表示に言及したときにもトリガーされる。大屏(大屏)には必ずこのスキルを使用すること——ダッシュボード(仪表盘/看板)には使用しない。ダッシュボードはまったく異なるレイアウトとスタイルシステムを使う。
Amazon 広告の Sponsored Products(SP)インサイトレポートスキルで、Audience のセグメント別パフォーマンスと Search Term Impression Share/Rank(検索語のインプレッションシェア/ランク)という 2 種類の Amazon Ads Reporting API v1 beta レポートを統一的に取得します。profile から advertiser account へのマッピング、レポート作成、ステータスのポーリング、複数シャードの CSV ダウンロードとディスクへの保存を自動で行います。ユーザーが SP オーディエンスレポート、SP 検索語インプレッションシェア、またはインプレッションシェアランクを明示的に要求した場合にのみトリガーされます。通常の SP 検索語パフォーマンスレポート、SB/SD/DSP レポートではトリガーしてはいけません。このスキルは linkfox-amazon-ads-auth に依存しています。
AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。
