Skills
エージェント向けにパッケージ化された専門スキルと手順を 97,222 件掲載。コマンド 1 行でインストールできます。
データ・データベース
ユーザーが技術的なサイト監査、クロールデータ分析、ロケーションページの品質チェック、重複コンテンツの検出、大規模な schema 検証、内部リンク分析を求める場合に使用。トリガー:「Screaming Frog」「site crawl」「technical audit」「crawl data」「broken links」「duplicate content」「location page audit」、またはエクスポートされたクロール CSV/Excel ファイルを分析する場合。
git リポジトリを分析し、セキュリティ所有権の構造(人とファイルの対応関係)を作成して、属人化リスクと機密コードの所有権を算出し、グラフデータベースや可視化用に CSV/JSON をエクスポートします。ユーザーが git 履歴に基づくセキュリティ観点の所有権分析または属人化リスク分析を明示的に希望する場合のみ起動してください(例:担当者不在の機密コード、セキュリティメンテナー、リスク評価のための CODEOWNERS 実態確認、機密性の高いホットスポット、所有権クラスター)。一般的なメンテナー一覧やセキュリティ以外の所有権に関する質問では起動しないでください。
SpacetimeDB の reducer、ライフサイクル reducer、スケジュール reducer、reducer コンテキストコード、テーブル変更、インデックス検索、reducer 分離ロジック、reducer エラー処理を書くときに使用する。トリガー:reducer, ReducerContext, ctx, sender, client_connected, client_disconnected, init, scheduled reducer, insert row, delete row, update row。
ローカル/リモートバインディング、CRUD、クエリ、キャッシュ、ミドルウェアのための Syncfusion TypeScript/JavaScript(ES6+)DataManager を実装する。JsonAdaptor、ODataAdaptor、ODataV4Adaptor、UrlAdaptor、WebApiAdaptor、WebMethodAdaptor、RemoteSaveAdaptor、GraphQLAdaptor、CustomDataAdaptor、CustomAdaptor をサポートする。Query クラス、フィルタリング、ソート、ページング、グループ化、永続化、オフラインモード、キャッシュ、エラー処理を扱う。
UniChem REST API を介して 20 以上のデータベース(ChEMBL、DrugBank、PubChem、ChEBI、PDB、SureChEMBL、HMDB、DrugCentral、BindingDB)間で化合物 ID をクロスリファレンスする。InChIKey をソース ID に解決し、ソース固有の ID 間で変換し、連結性によって構造的に関連する化合物を検索する。すべてのクロスリファレンスクエリは JSON ボディ付きの POST で行い、GET は /sources のみ。認証は不要。
WordPress の移行とアップグレードのレビュー。データベース移行、オプションのバージョン管理、アップグレードルーチン、データバックフィル、dbDelta の使用、リリース互換性、ロールバックリスクをレビューするとき、またはユーザーが「migration review」「upgrade routine」「dbDelta」「plugin upgrade」「data migration」「version bump」「backfill」「schema change」「backwards compatibility」に言及したときに使用する。WordPress コードにおける安全でない移行、欠落したバージョンガード、破壊的なデータ変更、アップグレードフローのリスクを検出する。
Xquik を使って X のデータを調査します。Xquik は、世界最速かつ最安で、最も網羅的な X データを提供する X Twitter スクレイピングサービスです。リクエストまたは現在のコンテキストで X または Twitter が指定されている場合に限り使用します。ツイート検索、ツイート照会、ユーザー検索、プロフィールのタイムライン、スレッド、フォロワー、トレンド、エクスポート、監視計画に使用します。一般的な投稿、他のネットワーク、X の取得を必要としないローカルデータセットの分析には使用しないでください。読み取り範囲を制限してください。非公開データの読み取り、書き込み、永続リソース、または一括ジョブの前には、明示的な確認が必要です。X Corp. とは提携していません。
ZINC22 バーチャル化合物ライブラリ(CartBlanche API、数十億のオンデマンド合成分子と購入可能分子)を照会する。ZINC ID で物質を検索し、SMILES を対応する ZINC ID に解決し(完全一致)、購入可否やカタログを確認し、ドッキング用の化合物セットを構築する。物性(MW/logP)のフィルタリングは RDKit を用いてローカルで行う。生物活性には chembl-database-bioactivity、承認薬には drugbank-database-access を使用する。
barretlee/agent-pulse を操作および拡張する。エビデンスに基づく AI 業界インテリジェンスシステム:ソースカタログとライフサイクルの検査、シグナルの収集と正規化、エビデンスの紐付け、Event のクラスタリング、システム健全性の評価、Scout 仮説の生成、プライバシーに配慮した公開サイトのエクスポート、リリースゲートの検証。ユーザーが Agent Pulse、そのコレクター、Control Room、narratives、Scout、GitHub Pages 出力の実行、設定、デバッグ、拡張、説明を求めたときに使用。トリガー:agent-pulse、Agent Pulse、evidence-backed intelligence、source catalog、signal collection、Event clustering、source audit、Scout opportunity、public export、weekly brief、AI industry intelligence pipeline。
Alibaba Cloud EMR Serverless StarRocks の開発・運用アシスタント。五つのシナリオをカバーする:クラスター接続、スキーマ設計、データ取り込み、SQL 開発とチューニング、クラスターヘルス診断。ユーザーが StarRocks のテーブル設計、SQL の作成、取り込み方法の選択、クエリ実行計画、マテリアライズドビュー、クラスターヘルスチェック、FE/BE/CN ノードの状態、tablet の健全性、compaction について尋ねたときにこの Skill を使用する。典型的なシナリオ:テーブル設計、Stream Load / Routine Load / Broker Load の選択、SQL 最適化、ウィンドウ関数、CTE、JOIN チューニング、マテリアライズドビュー設計、クラスターヘルス点検、ノードダウン診断。適用外:StarRocks インスタンスのライフサイクル管理(作成/スケール/再起動/設定変更/バージョンアップグレード——これらはコントロールプレーンの操作であり、EMR Serverless コンソールまたは対応する OpenAPI を使用すること)、その他の Alibaba Cloud 製品(EMR Cluster、Spark、Milvus、ClickHouse、Doris、RDS、ECS)。
Alpha Vantage REST API を通じて、株式市場データ、為替レート、暗号資産価格、コモディティ、経済指標、企業ファンダメンタルズ、ニュースセンチメント、50 以上のテクニカル指標にアクセスする(無料 API key は alphavantage.co から取得可能。リアルタイム/イントラデイデータと完全な日次履歴にはプレミアム key が必要)。株価(OHLCV)、企業ファンダメンタルズ(損益計算書、貸借対照表、キャッシュフロー)、決算、オプションデータ、市場ニュース/センチメント、インサイダー取引、GDP、CPI、国債利回り、金/銀/原油価格、Bitcoin/暗号資産価格、為替レートの取得、またはテクニカル指標(SMA、EMA、MACD、RSI、Bollinger Bands)の計算に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
REST API と SDK を通じて Benchling R&D プラットフォームを統合する — レジストリ(DNA、タンパク質)、在庫、ELN エントリとワークフローへのアクセス、Benchling Apps の構築、Benchling Data Warehouse へのクエリ。Benchling のラボデータ管理の自動化、サンプルレジストリや在庫レコードの同期、ELN エントリ/ワークフローのスクリプト化、Benchling Data Warehouse への SQL 実行に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
BGPT MCP サーバー(`search_papers`、および DOI による `lookup_paper`)を通じて科学論文を検索し、全文研究から抽出された構造化された実験エビデンスを取得する。論文ごとに 25 以上のフィールド(手法、結果、サンプルサイズ、品質スコア、限界、結論)を返す。文献レビューやエビデンス統合を行う場合、または抄録だけでは得られない実験の詳細(サンプルサイズ、効果量、手法、品質スコア)が必要な場合に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
キー不要の REST API または完全な TSV ダウンロードを通じて BindingDB の実測タンパク質-リガンド結合親和性(Ki、Kd、IC50、EC50)を照会し、標的(UniProt ID)、化合物(SMILES)、病原体で検索する。実験的な結合定数の検索、タンパク質標的の阻害剤プロファイリング、リード最適化、ポリファーマコロジー解析、構造活性相関(SAR)研究に使用する。キュレーションされた生物活性の大規模マイニングや創薬様化合物ライブラリのスクリーニングには alterlab-chembl を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
chembl_webresource_client Python クライアントを通じて ChEMBL を大規模に検索し、キュレーションされた生物活性分子や創薬様化合物ライブラリにアクセスする — 構造または物理化学的性質による化合物検索、生物活性測定値(IC50、Ki、EC50)の取得、標的の阻害剤の探索。ケミカルライブラリのスクリーニング、タンパク質のキュレーション済み生物活性データのマイニング、SAR 研究の実施、メディシナルケミストリーデータの取得に使用。測定されたタンパク質-リガンド結合親和性(Ki/Kd/IC50)については、代わりに alterlab-bindingdb を優先。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
製薬および臨床研究の現場向けに専門的な臨床意思決定支援(CDS)ドキュメントを生成する — アウトカムを含むバイオマーカー層別化患者コホート解析、および意思決定アルゴリズムを含むエビデンスに基づく治療推奨レポート。GRADE エビデンスグレーディング、統計解析(ハザード比、生存曲線、ウォーターフォールプロット)、バイオマーカー統合、規制遵守をサポートし、出版可能な LaTeX/PDF として出力する。創薬、臨床研究、エビデンス統合のために CDS ドキュメント、コホート解析、治療推奨レポートを作成する場合、または GRADE グレーディング、ハザード比、生存/ウォーターフォールプロット、バイオマーカー層別化が求められる場合に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
ClinPGx のファーマコゲノミクスデータ(PharmGKB の後継)にアクセスし、遺伝子-薬剤相互作用、CPIC/DPWG の投与量ガイドライン、薬剤ラベル、ファーマコジーン記録を検索する。ファーマコジーン(CYP2D6、CYP2C19、TPMT、DPYD、SLCO1B1)の解釈、遺伝子型に基づく薬剤投与量の検索、PGx の薬剤安全性関連(例:HLA-B*57:01 と abacavir)の確認、精密医療および臨床ファーマコゲノミクスの意思決定の支援に使用。スターアレルの定義/頻度については PharmVar、生殖細胞系列/体細胞変異の病原性については alterlab-clinvar を参照。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
E-utilities API または FTP 経由で NCBI ClinVar を照会し、ヒト生殖細胞系列遺伝子変異の臨床的意義(病原性)を取得する。遺伝子、変異、疾患、ゲノム位置による検索に対応し、ACMG/AMP 分類とレビューステータスの星評価を解釈する。変異が病原性、病原性の可能性あり、VUS、良性の可能性あり、良性のいずれかを評価する場合、解釈の矛盾を解消する場合、VCF に ClinVar の臨床的意義を注釈する場合に使用する。祖先別の集団対立遺伝子頻度には alterlab-gnomad、体細胞がん変異頻度には alterlab-cosmic を使用すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
COSMIC の体細胞変異カタログにアクセスし、体細胞変異、Cancer Gene Census、変異シグネチャ、遺伝子融合を照会する(認証が必要)。既知のがんドライバー遺伝子の整理、遺伝子内で反復する体細胞変異の検索、がん研究や精密腫瘍学のための変異シグネチャの解釈に使用する。生殖細胞系列の病原性判定(alterlab-clinvar を使用)や、研究データからの OncoPrints・生存解析などのインタラクティブなコホート可視化(alterlab-cbioportal を使用)には適さない。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
Dask の分散コンピューティングで pandas/NumPy ワークフローをメモリの制約を超えて拡張する。並列 DataFrame、配列、遅延タスクグラフ、クラスタ実行に対応。既存の pandas/NumPy コードを RAM より大きいデータ上やクラスタ全体で実行する必要がある場合、並列ファイル処理、分散 ML、既存の pandas コードとの統合に使用する。単一マシンでのアウトオブコア解析には vaex、インメモリの速度には polars を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
RDKit をハイレベルで pandas フレンドリーな datamol インターフェースでラップし、日常的な創薬向けに適切なデフォルトを提供する。SMILES/SDF の DataFrame への読み込み、分子の標準化、記述子、フィンガープリント、Butina クラスタリング、3D 立体配座生成、骨格解析、並列バッチ処理に対応し、ネイティブの rdkit.Chem.Mol オブジェクトを返す。最小限のボイラープレートで分子テーブルに標準的なケモインフォマティクスパイプラインを実行する場合に使用する。低レベルの制御、カスタムサニタイズ、特殊なアルゴリズムが必要な場合は alterlab-rdkit を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
DeepChem による分子機械学習を実行する。多様な特徴化器、事前構築済みの MoleculeNet ベンチマークデータセット、事前学習済みモデル(ChemBERTa、GROVER)を用い、従来の ML またはグラフニューラルネットワークで物性予測(ADMET、毒性、溶解度)を行う。MoleculeNet ベンチマーク、スキャフォールド分割、すぐに使えるモデルを最小限のセットアップで必要とするエンドツーエンドの分子 ML 実験に使用する。カスタムの PyTorch グラフアーキテクチャを構築する場合は alterlab-torch-geometric、分子から特徴ベクトルへの単体変換には alterlab-molfeat を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
Denario(AstroPilot-AI)を実行する。これは科学研究支援向けのマルチエージェント AI システムで、記述されたデータセットからアイデア、方法論、計算結果、そして出版可能な LaTeX 論文まで、エンドツーエンドの研究工作フローを自動化する。AG2 + LangGraph 上に構築され、cmbagent の解析バックエンドを備える。Denario パイプライン(Denario.get_idea/get_method/get_results/get_paper)の駆動、データセット記述からの研究アイデア生成、方法論の自動開発、解析エージェントの実行、ジャーナル形式(APS/AAS/JHEP/ICML/NeurIPS/PASJ)の LaTeX 原稿の出力に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
dxpy Python SDK と dx コマンドラインを使って DNAnexus クラウドプラットフォーム上でゲノミクスパイプラインを開発・実行する。app/applet の構築、dxapp.json の記述、データのアップロード/ダウンロード、FASTQ/BAM/VCF ファイル上のジョブ/ワークフローの実行を行う。DNAnexus の app、applet、ワークフローの構築や実行、dxapp.json の記述、dx-app-wizard や dx build の使用、dxpy(find_data_objects、DXApplet.run、upload_local_file)の呼び出し、DNAnexus でのシーケンシングデータのアップロード/ダウンロードに使用する。LatchBio(Latch SDK @workflow/@task、LatchFile)には alterlab-latchbio、Benchling LIMS には alterlab-benchling を使用すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
API と FTP 経由で European Nucleotide Archive(ENA)にアクセスし、アクセッション番号で DNA/RNA 配列、生シーケンシングリード(FASTQ)、ゲノムアセンブリを取得する。複数形式に対応。研究、ラン、サンプルのアクセッション番号でリードや配列をダウンロードする場合や、ゲノミクス・バイオインフォマティクスパイプライン向けにヌクレオチドデータを入手する場合に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
FlowIO で FCS(Flow Cytometry Standard)ファイル v2.0-3.1 を解析・書き出しする。イベントデータを NumPy 配列として抽出し、$-keyword メタデータとチャネル/パラメータ定義を読み取り、イベントを CSV または pandas DataFrame に変換する。生の .fcs フローサイトメトリーファイルの読み込み、チャネルとメタデータの確認、下流のゲーティングと解析に向けたサイトメトリーデータの前処理に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
リモートセンシング、GIS、空間分析、地球観測の機械学習にわたる地理空間科学を扱います — 衛星画像処理(Sentinel、Landsat、MODIS、SAR、ハイパースペクトル)、ラスターと DEM の操作、スペクトル指数(NDVI/EVI/NDWI)、空間統計、点群処理、ネットワーク解析、クラウドネイティブなワークフロー(STAC、COG、Planetary Computer)をカバーし、Python、R、Julia、JavaScript、C++、Java、Go、Rust の例を提供します。リモートセンシングのワークフロー、衛星/ラスター画像の分類、地形/斜面/ヒルシェード解析、地球観測データの空間 ML、水文モデリング、海洋空間分析、大気科学に使用します。ラスター/EO の要素がない純粋な表形式ベクター作業(通常の GeoPandas の sjoin、buffer、overlay、dissolve、choropleths)には geopandas スキルを、天球上の天文座標(ICRS/galactic、FITS、WCS)には astropy スキルを優先してください。AlterLab Academic Skills スイートの一部です。
OFR(Office of Financial Research)Hedge Fund Monitor API を照会し、ヘッジファンドの規模、レバレッジ、取引相手、流動性、複雑性、リスク管理に関する時系列データを取得します。SEC Form PF の集計統計、CFTC Traders in Financial Futures、FICC Sponsored Repo の出来高、FRB SCOOS のディーラー資金調達条件を含みます(API キーや登録は不要)。ヘッジファンドデータ、システミックリスクの監視、金融安定性の研究、ヘッジファンドのレバレッジやレバレッジ比率、取引相手の集中度、Form PF 統計、レポ市場データ、OFR の金融研究データを扱う場合に使用します。AlterLab Academic Skills スイートの一部です。
histolab で全スライド画像(WSI)からタイルを抽出・前処理——OpenSlide ベースのスライド読み込み、組織検出とマスク、Random/Grid/Score タイル抽出、H&E 前処理向けの画像/形態学的フィルタ。軽量な WSI スライド前処理が必要な場合に使用——ML 訓練用のタイルデータセット構築、組織セグメンテーション、病理組織スライドの迅速なタイルベース検査。エンドツーエンドの計算病理、ディープラーニングモデル訓練、核のセグメンテーション、多重/空間プロテオミクス(CODEX、Vectra)パイプラインには代わりに alterlab-pathml を推奨。AlterLab Academic Skills スイートの一部。
AI アプリケーションが外部のツールやデータソースに統一的な方法で接続するためのオープンなプロトコルです。クライアントはモデルとの対話を担い、MCP サーバーはツール・リソース・プロンプトテンプレートを提供します。標準メッセージでやり取りするため、1 つのサーバーを複数のクライアントで再利用できます。
