mcpField

Skills

エージェント向けにパッケージ化された専門スキルと手順を 97,222 件掲載。コマンド 1 行でインストールできます。

データ・データベース

P
pymoo
pymoo
jaechang-hits / sciagent-skills

進化アルゴリズムによる単目的・多目的最適化のための Python フレームワーク。ベクトル化された目的関数と制約を定義し、NSGA-II、NSGA-III、MOEA/D、GA、差分進化で求解する。Pareto フロントの分析、トレードオフの可視化、演算子とコールバックのカスタマイズが可能。エンジニアリング設計、ハイパーパラメータ探索、相反する目的に適する。代替:scipy.optimize(単目的、勾配)、platypus、jMetalPy(Java)。

データ・データベース68
Q
qdrant-vector-database-integration
qdrant-vector-database-integration
giuseppe-trisciuoglio / developer-kit

LangChain4j との Qdrant ベクトルデータベース統合パターン。Java アプリケーション向けに埋め込みの保存、類似度検索、ベクトル管理を行う。RAG システム、セマンティック検索、レコメンデーションエンジン向けのベクトルベースの検索を実装する際に使用する。

データ・データベース68
R
recharts
recharts
tartinerlabs / skills

Recharts でチャート、データ可視化、ダッシュボードを構築する場合に使用する。Recharts を HeroUI と統合する場合、チャートコンポーネントをレビューする場合、レスポンシブなチャートコンテナを作成する場合にも使用する。HeroUI v3 のデザイントークンと Tailwind CSS v4 でスタイルを適用した Recharts チャートを生成する。

デザイン・UI68
R
reduce-unoptimized-query-oracle
reduce-unoptimized-query-oracle
cockroachdb / cockroach

unoptimized-query-oracle のテスト失敗ログを、可能な限り単純な再現ケースに縮小する。失敗した roachtest の unoptimized-query-oracle*.log ファイルがあり、バグを再現する最小の SQL を見つける必要がある場合に使用する。

テスト・品質68
R
revenue-health-dashboard
revenue-health-dashboard
gtmagents / gtm-agents

レベニュー KPI、ガードレール、アクションの注記のための可視化ブループリント。

データ・データベース68
S
saas-metrics-coach
saas-metrics-coach
borghei / claude-skills

ユーザーが「MRR を計算」「チャーンを分析」「SaaS 指標を算出」「コホート継続率分析を行う」「LTV または CAC を計算」「ユニットエコノミクスを評価」「サブスクリプション収益の成長を追跡」を求めたときに、このスキルを使用します。

データ・データベース68
S
score-optimizer
score-optimizer
xiaomoboy / claude-writing-skills

ユーザーがバイラル記事のスコアリングシステム自体を反復改善したい、ラベル付きサンプルに対してスコアリングプロンプトを校正・改善したい、または固定の記事セットでバッチスコアリング実験を行いたいときに使用します。評価スクリプトは固定のままで、スコアリングのルーブリック/プロンプトのみを進化させるプロンプト主体のスコアリング研究に最適です。

マーケティング・グロース68
S
screaming-frog-tool
screaming-frog-tool
garrettjsmith / localseoskills

ユーザーが技術的なサイト監査、クロールデータ分析、ロケーションページの品質チェック、重複コンテンツの検出、大規模な schema 検証、内部リンク分析を求める場合に使用。トリガー:「Screaming Frog」「site crawl」「technical audit」「crawl data」「broken links」「duplicate content」「location page audit」、またはエクスポートされたクロール CSV/Excel ファイルを分析する場合。

マーケティング・グロース68
S
security-ownership-map
security-ownership-map
davila7 / claude-code-templates

git リポジトリを分析し、セキュリティ所有権の構造(人とファイルの対応関係)を作成して、属人化リスクと機密コードの所有権を算出し、グラフデータベースや可視化用に CSV/JSON をエクスポートします。ユーザーが git 履歴に基づくセキュリティ観点の所有権分析または属人化リスク分析を明示的に希望する場合のみ起動してください(例:担当者不在の機密コード、セキュリティメンテナー、リスク評価のための CODEOWNERS 実態確認、機密性の高いホットスポット、所有権クラスター)。一般的なメンテナー一覧やセキュリティ以外の所有権に関する質問では起動しないでください。

セキュリティ68
S
segmentation-framework
segmentation-framework
gtmagents / gtm-agents

明確な基準と指標を用いて顧客セグメントを設計・文書化するために使用する。

マーケティング・グロース68
S
sentiment-analysis
sentiment-analysis
gtmagents / gtm-agents

コミュニティ全体の定性的なフィードバック、トレンド、リスクを解釈するために使用する

マーケティング・グロース68
S
sentiment-feedback-loop
sentiment-feedback-loop
gtmagents / gtm-agents

定性的なフィードバックを収集し、CS プレイブックに注入するプロセス。

データ・データベース68
S
simple-analytics
simple-analytics
membranedev / application-skills

Simple Analytics 連携。ウェブサイト、イベントを管理します。ユーザーが Simple Analytics のデータを操作したい場合に使用します。

マーケティング・グロース68
S
spacetimedb-databases
spacetimedb-databases
danmossa / spacetimedb-skills

SpacetimeDB データベースモジュールの作成、開発、ビルド、公開、移行、または考察を行うときに使用する。ローカル開発、モジュールのビルド/公開フロー、トランザクション、自動マイグレーション、増分マイグレーション、データベースチートシートを扱う。トリガー:database module, spacetime publish, build module, migration, transaction, atomicity, developing module。

データ・データベース68
S
spacetimedb-reducers
spacetimedb-reducers
danmossa / spacetimedb-skills

SpacetimeDB の reducer、ライフサイクル reducer、スケジュール reducer、reducer コンテキストコード、テーブル変更、インデックス検索、reducer 分離ロジック、reducer エラー処理を書くときに使用する。トリガー:reducer, ReducerContext, ctx, sender, client_connected, client_disconnected, init, scheduled reducer, insert row, delete row, update row。

開発68
S
startup-financial-modeling

ユーザーが「create financial projections」「build a financial model」「forecast revenue」「calculate burn rate」「estimate runway」「model cash flow」を求めたり、スタートアップ向けの 3〜5 年の財務計画を依頼した場合に、このスキルを使用する。

データ・データベース68
S
superior-database
superior-database
kodekateam / superior-skills

整合性とロールアウトの制約を明確にしたうえで、データベーススキーマ、クエリ、インデックス、トランザクション、マイグレーション、バックフィルを設計、実装、レビュー、修復します。データストアの動作やデータライフサイクルがタスクの主要部分である場合に使用します。スキーマと整合性の契約が変わらない通常の永続化呼び出しには使わないでください。

データ・データベース68
S
syncfusion-javascript-data-manager
syncfusion-javascript-data-manager
syncfusion / javascript-ui-controls-skills

ローカル/リモートバインディング、CRUD、クエリ、キャッシュ、ミドルウェアのための Syncfusion TypeScript/JavaScript(ES6+)DataManager を実装する。JsonAdaptor、ODataAdaptor、ODataV4Adaptor、UrlAdaptor、WebApiAdaptor、WebMethodAdaptor、RemoteSaveAdaptor、GraphQLAdaptor、CustomDataAdaptor、CustomAdaptor をサポートする。Query クラス、フィルタリング、ソート、ページング、グループ化、永続化、オフラインモード、キャッシュ、エラー処理を扱う。

開発68
T
tanstack-charts
tanstack-charts
lukasa1993 / tanstack-skills-extracted

マーク、スケール、レイアウト、インタラクション、アクセシビリティ、レンダリング、フレームワークアダプターのための型付きチャート文法ガイダンス。プロジェクトで TanStack Charts を使用する場合、またはセットアップ、実装、デバッグ、テスト、移行、統合のガイダンスが必要なタスクで使用します。

デザイン・UI68
T
terrain-hydrology
terrain-hydrology
muend / geoai-skills

地形、排水、可視領域、または標高からの可視性分析では、DEM や正しいサーフェスを選択する前であっても常に呼び出す。DTM と DSM の選択、傾斜、傾斜方位、曲率、ヒルシェード、条件付け、流向/流量、河川、流域、集水域を扱う。LiDAR や写真測量の点群から標高サーフェスを作成する必要がある場合にのみ、先に point-cloud-lidar を使用する。

データ・データベース68
U
unichem-database
unichem-database
jaechang-hits / sciagent-skills

UniChem REST API を介して 20 以上のデータベース(ChEMBL、DrugBank、PubChem、ChEBI、PDB、SureChEMBL、HMDB、DrugCentral、BindingDB)間で化合物 ID をクロスリファレンスする。InChIKey をソース ID に解決し、ソース固有の ID 間で変換し、連結性によって構造的に関連する化合物を検索する。すべてのクロスリファレンスクエリは JSON ボディ付きの POST で行い、GET は /sources のみ。認証は不要。

データ・データベース68
U
using-geoscience-skills
using-geoscience-skills
steadfastasart / geoscience-skills

Python コーディングタスク向けの地球科学スキルを発見して組み合わせます。地球科学ライブラリの選択、データ形式や手法に対応するスキルの検索、地震、検層、地質モデリング、インバージョンなどの地球科学領域にまたがる作業の計画に使用します。

エージェントワークフロー68
V
visualization-patterns
visualization-patterns
gtmagents / gtm-agents

GTM のステークホルダー向けにダッシュボード、レポート、ナラティブを設計する際に使用する。

デザイン・UI68
W
wechat-article-fetcher
wechat-article-fetcher
liuzln / openclaw-skills

WeChat 公式アカウントの記事を全文と画像付きで取得して保存する。任意の WeChat 記事 URL、画像の自動ダウンロード、JSON エクスポート、全ページのスクリーンショットに対応。WeChat 公式アカウントの記事をアーカイブ、保存、分析する必要がある場合に使用する。

生産性68
W
wp-migration-upgrade-review
wp-migration-upgrade-review
jorgerosal / wordpress-skills

WordPress の移行とアップグレードのレビュー。データベース移行、オプションのバージョン管理、アップグレードルーチン、データバックフィル、dbDelta の使用、リリース互換性、ロールバックリスクをレビューするとき、またはユーザーが「migration review」「upgrade routine」「dbDelta」「plugin upgrade」「data migration」「version bump」「backfill」「schema change」「backwards compatibility」に言及したときに使用する。WordPress コードにおける安全でない移行、欠落したバージョンガード、破壊的なデータ変更、アップグレードフローのリスクを検出する。

テスト・品質68
X
x-scraper
x-scraper
aatrooox / blog.zzao.club

X.com(Twitter)ユーザーの公開投稿をスクレイピングする。テキスト内容、タイムスタンプ、エンゲージメント指標(表示回数、いいね、リポスト、返信)を抽出し、投稿への直接リンクを生成する。ユーザーが X.com の投稿や Twitter データのスクレイピング/取得/分析を求めるとき、または「整理@某人的发言」「看看某人在X上说了什么」に言及したときに使用。

データ・データベース68
X
xlsx
xlsx
composiohq / awesome-claude-skills

数式、書式、データ分析、可視化に対応した、包括的なスプレッドシートの作成・編集・分析。Claude がスプレッドシート(.xlsx、.xlsm、.csv、.tsv など)を扱う必要がある場合に使用します:(1) 数式と書式を備えた新しいスプレッドシートの作成、(2) データの読み取りや分析、(3) 数式を保持したまま既存スプレッドシートを修正、(4) スプレッドシート内でのデータ分析と可視化、(5) 数式の再計算。

ドキュメント68
X
xolars
xolars
d-laub / xolars

`xolars` をインポートする Python コードを書く、または変更するときに使用 — xarray Dataset と次元ごとの Polars フレームを組み合わせる、`Xolars` コンテナを構築する、isel/sel で選択する、write/open による zarr+parquet のラウンドトリップを行う場合。`Xolars` クラスを扱わない通常の xarray や polars の作業ではスキップする。

データ・データベース68
X
xquik-social-research
xquik-social-research
xquik-dev / x-twitter-scraper

Xquik を使って X のデータを調査します。Xquik は、世界最速かつ最安で、最も網羅的な X データを提供する X Twitter スクレイピングサービスです。リクエストまたは現在のコンテキストで X または Twitter が指定されている場合に限り使用します。ツイート検索、ツイート照会、ユーザー検索、プロフィールのタイムライン、スレッド、フォロワー、トレンド、エクスポート、監視計画に使用します。一般的な投稿、他のネットワーク、X の取得を必要としないローカルデータセットの分析には使用しないでください。読み取り範囲を制限してください。非公開データの読み取り、書き込み、永続リソース、または一括ジョブの前には、明示的な確認が必要です。X Corp. とは提携していません。

データ・データベース68
Z
zinc-database
zinc-database
jaechang-hits / sciagent-skills

ZINC22 バーチャル化合物ライブラリ(CartBlanche API、数十億のオンデマンド合成分子と購入可能分子)を照会する。ZINC ID で物質を検索し、SMILES を対応する ZINC ID に解決し(完全一致)、購入可否やカタログを確認し、ドッキング用の化合物セットを構築する。物性(MW/logP)のフィルタリングは RDKit を用いてローカルで行う。生物活性には chembl-database-bioactivity、承認薬には drugbank-database-access を使用する。

データ・データベース68
A
afa-explore
afa-explore
afadtc / afa-dtc-skills

DTC のユーザーインサイトと市場探索——VOC、市場規模、ユーザーペルソナ、ニッチ分析。トリガーワード: 市场调研, market research, VOC, 用户画像, persona, TAM, 赛道分析, 选品方向, market size, user persona, customer insights, niche analysis。複雑な問題は先に afa を経由する。

マーケティング・グロース67
A
afa-retain
afa-retain
afadtc / afa-dtc-skills

DTC のリテンションと LTV 成長——リテンション診断、RFM+LTV セグメンテーション、マイクロロイヤルティ、サブスクの解約防止、ウィンバック。トリガーワード: 留存, retention, 复购, LTV, 流失, churn, 会员, 订阅, win-back, RFM分层, repeat purchase, loyalty program, subscription retention。複雑な問題は先に afa を経由する。

マーケティング・グロース67
A
agent-pulse
agent-pulse
akillness / jeo-skills

barretlee/agent-pulse を操作および拡張する。エビデンスに基づく AI 業界インテリジェンスシステム:ソースカタログとライフサイクルの検査、シグナルの収集と正規化、エビデンスの紐付け、Event のクラスタリング、システム健全性の評価、Scout 仮説の生成、プライバシーに配慮した公開サイトのエクスポート、リリースゲートの検証。ユーザーが Agent Pulse、そのコレクター、Control Room、narratives、Scout、GitHub Pages 出力の実行、設定、デバッグ、拡張、説明を求めたときに使用。トリガー:agent-pulse、Agent Pulse、evidence-backed intelligence、source catalog、signal collection、Event clustering、source audit、Scout opportunity、public export、weekly brief、AI industry intelligence pipeline。

データ・データベース67
A
alibabacloud-emr-starrocks-assistant
alibabacloud-emr-starrocks-assistant
aliyun / alibabacloud-aiops-skills

Alibaba Cloud EMR Serverless StarRocks の開発・運用アシスタント。五つのシナリオをカバーする:クラスター接続、スキーマ設計、データ取り込み、SQL 開発とチューニング、クラスターヘルス診断。ユーザーが StarRocks のテーブル設計、SQL の作成、取り込み方法の選択、クエリ実行計画、マテリアライズドビュー、クラスターヘルスチェック、FE/BE/CN ノードの状態、tablet の健全性、compaction について尋ねたときにこの Skill を使用する。典型的なシナリオ:テーブル設計、Stream Load / Routine Load / Broker Load の選択、SQL 最適化、ウィンドウ関数、CTE、JOIN チューニング、マテリアライズドビュー設計、クラスターヘルス点検、ノードダウン診断。適用外:StarRocks インスタンスのライフサイクル管理(作成/スケール/再起動/設定変更/バージョンアップグレード——これらはコントロールプレーンの操作であり、EMR Serverless コンソールまたは対応する OpenAPI を使用すること)、その他の Alibaba Cloud 製品(EMR Cluster、Spark、Milvus、ClickHouse、Doris、RDS、ECS)。

データ・データベース67
A
aliyun-qwen-ocr
aliyun-qwen-ocr
cinience / alicloud-skills

Alibaba Cloud Model Studio の Qwen OCR モデル(`qwen-vl-ocr`、`qwen-vl-ocr-latest` およびスナップショット)を使った OCR 特化の抽出が必要なときに使用する。ドキュメント解析、表の解析、多言語 OCR、数式認識、重要情報の抽出を含む。

ドキュメント67
A
alterlab-alpha-vantage
alterlab-alpha-vantage
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

Alpha Vantage REST API を通じて、株式市場データ、為替レート、暗号資産価格、コモディティ、経済指標、企業ファンダメンタルズ、ニュースセンチメント、50 以上のテクニカル指標にアクセスする(無料 API key は alphavantage.co から取得可能。リアルタイム/イントラデイデータと完全な日次履歴にはプレミアム key が必要)。株価(OHLCV)、企業ファンダメンタルズ(損益計算書、貸借対照表、キャッシュフロー)、決算、オプションデータ、市場ニュース/センチメント、インサイダー取引、GDP、CPI、国債利回り、金/銀/原油価格、Bitcoin/暗号資産価格、為替レートの取得、またはテクニカル指標(SMA、EMA、MACD、RSI、Bollinger Bands)の計算に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-benchling
alterlab-benchling
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

REST API と SDK を通じて Benchling R&D プラットフォームを統合する — レジストリ(DNA、タンパク質)、在庫、ELN エントリとワークフローへのアクセス、Benchling Apps の構築、Benchling Data Warehouse へのクエリ。Benchling のラボデータ管理の自動化、サンプルレジストリや在庫レコードの同期、ELN エントリ/ワークフローのスクリプト化、Benchling Data Warehouse への SQL 実行に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-bgpt-search
alterlab-bgpt-search
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

BGPT MCP サーバー(`search_papers`、および DOI による `lookup_paper`)を通じて科学論文を検索し、全文研究から抽出された構造化された実験エビデンスを取得する。論文ごとに 25 以上のフィールド(手法、結果、サンプルサイズ、品質スコア、限界、結論)を返す。文献レビューやエビデンス統合を行う場合、または抄録だけでは得られない実験の詳細(サンプルサイズ、効果量、手法、品質スコア)が必要な場合に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

生産性67
A
alterlab-bindingdb
alterlab-bindingdb
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

キー不要の REST API または完全な TSV ダウンロードを通じて BindingDB の実測タンパク質-リガンド結合親和性(Ki、Kd、IC50、EC50)を照会し、標的(UniProt ID)、化合物(SMILES)、病原体で検索する。実験的な結合定数の検索、タンパク質標的の阻害剤プロファイリング、リード最適化、ポリファーマコロジー解析、構造活性相関(SAR)研究に使用する。キュレーションされた生物活性の大規模マイニングや創薬様化合物ライブラリのスクリーニングには alterlab-chembl を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-brenda
alterlab-brenda
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

SOAP API を通じて BRENDA 酵素データベースにアクセスし、EC number で索引付けされた速度論パラメータ(Km、kcat、Ki)、反応式、生物種データ、基質特異的な酵素情報を取得する。生化学研究や代謝経路解析のために、酵素速度論、ターンオーバー数、基質特異性を調べるときに使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-chembl
alterlab-chembl
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

chembl_webresource_client Python クライアントを通じて ChEMBL を大規模に検索し、キュレーションされた生物活性分子や創薬様化合物ライブラリにアクセスする — 構造または物理化学的性質による化合物検索、生物活性測定値(IC50、Ki、EC50)の取得、標的の阻害剤の探索。ケミカルライブラリのスクリーニング、タンパク質のキュレーション済み生物活性データのマイニング、SAR 研究の実施、メディシナルケミストリーデータの取得に使用。測定されたタンパク質-リガンド結合親和性(Ki/Kd/IC50)については、代わりに alterlab-bindingdb を優先。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-clinical-decision
alterlab-clinical-decision
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

製薬および臨床研究の現場向けに専門的な臨床意思決定支援(CDS)ドキュメントを生成する — アウトカムを含むバイオマーカー層別化患者コホート解析、および意思決定アルゴリズムを含むエビデンスに基づく治療推奨レポート。GRADE エビデンスグレーディング、統計解析(ハザード比、生存曲線、ウォーターフォールプロット)、バイオマーカー統合、規制遵守をサポートし、出版可能な LaTeX/PDF として出力する。創薬、臨床研究、エビデンス統合のために CDS ドキュメント、コホート解析、治療推奨レポートを作成する場合、または GRADE グレーディング、ハザード比、生存/ウォーターフォールプロット、バイオマーカー層別化が求められる場合に使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

ドキュメント67
A
alterlab-clinicaltrials
alterlab-clinicaltrials
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

API v2 を通じて ClinicalTrials.gov を検索し、疾患、薬剤、地域、募集状況、フェーズで試験を検索し、NCT ID で試験の詳細を取得する。介入試験や観察研究の検索、患者マッチングのための試験ステータスと適格性の確認、研究のための臨床試験記録のエクスポートに使用。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-clinpgx
alterlab-clinpgx
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

ClinPGx のファーマコゲノミクスデータ(PharmGKB の後継)にアクセスし、遺伝子-薬剤相互作用、CPIC/DPWG の投与量ガイドライン、薬剤ラベル、ファーマコジーン記録を検索する。ファーマコジーン(CYP2D6、CYP2C19、TPMT、DPYD、SLCO1B1)の解釈、遺伝子型に基づく薬剤投与量の検索、PGx の薬剤安全性関連(例:HLA-B*57:01 と abacavir)の確認、精密医療および臨床ファーマコゲノミクスの意思決定の支援に使用。スターアレルの定義/頻度については PharmVar、生殖細胞系列/体細胞変異の病原性については alterlab-clinvar を参照。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-clinvar
alterlab-clinvar
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

E-utilities API または FTP 経由で NCBI ClinVar を照会し、ヒト生殖細胞系列遺伝子変異の臨床的意義(病原性)を取得する。遺伝子、変異、疾患、ゲノム位置による検索に対応し、ACMG/AMP 分類とレビューステータスの星評価を解釈する。変異が病原性、病原性の可能性あり、VUS、良性の可能性あり、良性のいずれかを評価する場合、解釈の矛盾を解消する場合、VCF に ClinVar の臨床的意義を注釈する場合に使用する。祖先別の集団対立遺伝子頻度には alterlab-gnomad、体細胞がん変異頻度には alterlab-cosmic を使用すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-cosmic
alterlab-cosmic
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

COSMIC の体細胞変異カタログにアクセスし、体細胞変異、Cancer Gene Census、変異シグネチャ、遺伝子融合を照会する(認証が必要)。既知のがんドライバー遺伝子の整理、遺伝子内で反復する体細胞変異の検索、がん研究や精密腫瘍学のための変異シグネチャの解釈に使用する。生殖細胞系列の病原性判定(alterlab-clinvar を使用)や、研究データからの OncoPrints・生存解析などのインタラクティブなコホート可視化(alterlab-cbioportal を使用)には適さない。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-dask
alterlab-dask
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

Dask の分散コンピューティングで pandas/NumPy ワークフローをメモリの制約を超えて拡張する。並列 DataFrame、配列、遅延タスクグラフ、クラスタ実行に対応。既存の pandas/NumPy コードを RAM より大きいデータ上やクラスタ全体で実行する必要がある場合、並列ファイル処理、分散 ML、既存の pandas コードとの統合に使用する。単一マシンでのアウトオブコア解析には vaex、インメモリの速度には polars を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-datamol
alterlab-datamol
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

RDKit をハイレベルで pandas フレンドリーな datamol インターフェースでラップし、日常的な創薬向けに適切なデフォルトを提供する。SMILES/SDF の DataFrame への読み込み、分子の標準化、記述子、フィンガープリント、Butina クラスタリング、3D 立体配座生成、骨格解析、並列バッチ処理に対応し、ネイティブの rdkit.Chem.Mol オブジェクトを返す。最小限のボイラープレートで分子テーブルに標準的なケモインフォマティクスパイプラインを実行する場合に使用する。低レベルの制御、カスタムサニタイズ、特殊なアルゴリズムが必要な場合は alterlab-rdkit を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-deepchem
alterlab-deepchem
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

DeepChem による分子機械学習を実行する。多様な特徴化器、事前構築済みの MoleculeNet ベンチマークデータセット、事前学習済みモデル(ChemBERTa、GROVER)を用い、従来の ML またはグラフニューラルネットワークで物性予測(ADMET、毒性、溶解度)を行う。MoleculeNet ベンチマーク、スキャフォールド分割、すぐに使えるモデルを最小限のセットアップで必要とするエンドツーエンドの分子 ML 実験に使用する。カスタムの PyTorch グラフアーキテクチャを構築する場合は alterlab-torch-geometric、分子から特徴ベクトルへの単体変換には alterlab-molfeat を優先すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-denario
alterlab-denario
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

Denario(AstroPilot-AI)を実行する。これは科学研究支援向けのマルチエージェント AI システムで、記述されたデータセットからアイデア、方法論、計算結果、そして出版可能な LaTeX 論文まで、エンドツーエンドの研究工作フローを自動化する。AG2 + LangGraph 上に構築され、cmbagent の解析バックエンドを備える。Denario パイプライン(Denario.get_idea/get_method/get_results/get_paper)の駆動、データセット記述からの研究アイデア生成、方法論の自動開発、解析エージェントの実行、ジャーナル形式(APS/AAS/JHEP/ICML/NeurIPS/PASJ)の LaTeX 原稿の出力に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

エージェントワークフロー67
A
alterlab-dnanexus
alterlab-dnanexus
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

dxpy Python SDK と dx コマンドラインを使って DNAnexus クラウドプラットフォーム上でゲノミクスパイプラインを開発・実行する。app/applet の構築、dxapp.json の記述、データのアップロード/ダウンロード、FASTQ/BAM/VCF ファイル上のジョブ/ワークフローの実行を行う。DNAnexus の app、applet、ワークフローの構築や実行、dxapp.json の記述、dx-app-wizard や dx build の使用、dxpy(find_data_objects、DXApplet.run、upload_local_file)の呼び出し、DNAnexus でのシーケンシングデータのアップロード/ダウンロードに使用する。LatchBio(Latch SDK @workflow/@task、LatchFile)には alterlab-latchbio、Benchling LIMS には alterlab-benchling を使用すること。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

クラウド・DevOps67
A
alterlab-drugbank
alterlab-drugbank
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

DrugBank データベースの医薬品情報にアクセスして分析する。薬物の特性、相互作用、標的、パスウェイ、化学構造、薬理学データを扱う。医薬品データの扱い、創薬研究、薬物間相互作用解析、標的の同定、化学的類似性検索、ADMET 予測、または DrugBank の詳細な薬物・薬物-標的レコードを必要とするあらゆるタスクに使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-ena
alterlab-ena
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

API と FTP 経由で European Nucleotide Archive(ENA)にアクセスし、アクセッション番号で DNA/RNA 配列、生シーケンシングリード(FASTQ)、ゲノムアセンブリを取得する。複数形式に対応。研究、ラン、サンプルのアクセッション番号でリードや配列をダウンロードする場合や、ゲノミクス・バイオインフォマティクスパイプライン向けにヌクレオチドデータを入手する場合に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-etetoolkit
alterlab-etetoolkit
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

ETE Toolkit(ete3)で系統樹をプログラム的に操作、注釈、描画する。Newick/NHX の解析と編集、重複/種分化イベントの検出、オルソロジーとパラロジーの推定、NCBI 分類の照会、PDF/SVG 図のエクスポートに対応。系統樹ファイルの走査や再フォーマット、系統ゲノム比較解析、Python による出版向け系統樹グラフィックの作成に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-fda
alterlab-fda
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

openFDA API を照会し、医薬品、医療機器、有害事象報告、リコール、規制申請(510k、PMA)、物質識別(UNII)のデータを取得します。FDA の安全性データ、ファーマコビジランスと有害事象シグナル、医療機器の承認、医薬品ラベル、リコール記録を検索して規制データ分析や安全性研究を行う場合に使用します。AlterLab Academic Skills スイートの一部です。

データ・データベース67
A
alterlab-flowio
alterlab-flowio
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

FlowIO で FCS(Flow Cytometry Standard)ファイル v2.0-3.1 を解析・書き出しする。イベントデータを NumPy 配列として抽出し、$-keyword メタデータとチャネル/パラメータ定義を読み取り、イベントを CSV または pandas DataFrame に変換する。生の .fcs フローサイトメトリーファイルの読み込み、チャネルとメタデータの確認、下流のゲーティングと解析に向けたサイトメトリーデータの前処理に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-gene-db
alterlab-gene-db
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

E-utilities と Datasets API 経由で NCBI Gene を照会し、遺伝子シンボルまたは Gene ID で検索して遺伝子情報(RefSeq、GO ターム、ゲノム位置、関連表現型)を取得する。バッチ検索にも対応。遺伝子シンボルを ID に解決する場合、遺伝子リストに注釈を付ける場合、下流解析向けに機能・位置に関する遺伝子メタデータを取得する場合に使用する。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

データ・データベース67
A
alterlab-geomaster
alterlab-geomaster
alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

リモートセンシング、GIS、空間分析、地球観測の機械学習にわたる地理空間科学を扱います — 衛星画像処理(Sentinel、Landsat、MODIS、SAR、ハイパースペクトル)、ラスターと DEM の操作、スペクトル指数(NDVI/EVI/NDWI)、空間統計、点群処理、ネットワーク解析、クラウドネイティブなワークフロー(STAC、COG、Planetary Computer)をカバーし、Python、R、Julia、JavaScript、C++、Java、Go、Rust の例を提供します。リモートセンシングのワークフロー、衛星/ラスター画像の分類、地形/斜面/ヒルシェード解析、地球観測データの空間 ML、水文モデリング、海洋空間分析、大気科学に使用します。ラスター/EO の要素がない純粋な表形式ベクター作業(通常の GeoPandas の sjoin、buffer、overlay、dissolve、choropleths)には geopandas スキルを、天球上の天文座標(ICRS/galactic、FITS、WCS)には astropy スキルを優先してください。AlterLab Academic Skills スイートの一部です。

データ・データベース67
A
alterlab-hedgefund-monitor
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alterlab-ieu / alterlab-academic-skills

OFR(Office of Financial Research)Hedge Fund Monitor API を照会し、ヘッジファンドの規模、レバレッジ、取引相手、流動性、複雑性、リスク管理に関する時系列データを取得します。SEC Form PF の集計統計、CFTC Traders in Financial Futures、FICC Sponsored Repo の出来高、FRB SCOOS のディーラー資金調達条件を含みます(API キーや登録は不要)。ヘッジファンドデータ、システミックリスクの監視、金融安定性の研究、ヘッジファンドのレバレッジやレバレッジ比率、取引相手の集中度、Form PF 統計、レポ市場データ、OFR の金融研究データを扱う場合に使用します。AlterLab Academic Skills スイートの一部です。

データ・データベース67
A
alterlab-histolab
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histolab で全スライド画像(WSI)からタイルを抽出・前処理——OpenSlide ベースのスライド読み込み、組織検出とマスク、Random/Grid/Score タイル抽出、H&E 前処理向けの画像/形態学的フィルタ。軽量な WSI スライド前処理が必要な場合に使用——ML 訓練用のタイルデータセット構築、組織セグメンテーション、病理組織スライドの迅速なタイルベース検査。エンドツーエンドの計算病理、ディープラーニングモデル訓練、核のセグメンテーション、多重/空間プロテオミクス(CODEX、Vectra)パイプラインには代わりに alterlab-pathml を推奨。AlterLab Academic Skills スイートの一部。

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